More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1178 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  100 
 
 
454 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  40.93 
 
 
465 aa  329  6e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  39.87 
 
 
484 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  38.88 
 
 
449 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  38.1 
 
 
452 aa  286  5.999999999999999e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  36.95 
 
 
459 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  36.04 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  38.29 
 
 
499 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  39.14 
 
 
450 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  39.14 
 
 
450 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.25 
 
 
457 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  38.69 
 
 
454 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  36.14 
 
 
456 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  35.46 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  34.39 
 
 
447 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  38.58 
 
 
439 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  35.76 
 
 
463 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  36.32 
 
 
462 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  35.63 
 
 
492 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  34.2 
 
 
446 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  32.29 
 
 
532 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  36.61 
 
 
463 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  34.68 
 
 
498 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  34.68 
 
 
498 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  32.45 
 
 
510 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  34.22 
 
 
493 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  33.26 
 
 
458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  32.15 
 
 
494 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
494 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  34 
 
 
493 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  32.15 
 
 
578 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  34 
 
 
493 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 
493 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  33.04 
 
 
498 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  31.49 
 
 
490 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  31.43 
 
 
469 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  30.12 
 
 
459 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  30.96 
 
 
494 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  31.87 
 
 
487 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  32.73 
 
 
512 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  32.95 
 
 
445 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 
492 aa  186  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  31.94 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  27.47 
 
 
464 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  27.81 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.85 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  26.81 
 
 
592 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  28.38 
 
 
565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  27.42 
 
 
616 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  27.25 
 
 
496 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.85 
 
 
624 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 
469 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  27.03 
 
 
496 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.52 
 
 
619 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.11 
 
 
478 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.11 
 
 
478 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  29.18 
 
 
445 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.26 
 
 
625 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  27.65 
 
 
431 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  26.19 
 
 
619 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.58 
 
 
478 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25 
 
 
482 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  27.97 
 
 
435 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  28.83 
 
 
435 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.18 
 
 
482 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.18 
 
 
482 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.18 
 
 
482 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.8 
 
 
487 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 
478 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.21 
 
 
478 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 
478 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.42 
 
 
478 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 
478 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.37 
 
 
485 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  27.89 
 
 
491 aa  97.8  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.54 
 
 
487 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 
478 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.95 
 
 
490 aa  96.3  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.73 
 
 
490 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 
490 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.78 
 
 
495 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.96 
 
 
495 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.55 
 
 
525 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  22.61 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.73 
 
 
487 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.98 
 
 
528 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  21.95 
 
 
523 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  27.67 
 
 
427 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  24.25 
 
 
438 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.6 
 
 
479 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.37 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.93 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  25.11 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  22.32 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.17 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  26 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  28.1 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  26.33 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  26.27 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>