34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5079 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3193  methyltransferase type 11  78 
 
 		 689 aa  1157    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.212638  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  79.91 
 
 		 687 aa  1190    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5079  hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1421    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326804 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1533  amine oxidase  79.06 
 
 		 682 aa  1157    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3456  methyltransferase type 11  81.11 
 
 		 698 aa  1192    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0101492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2287  methyltransferase type 11  79.33 
 
 		 688 aa  1160    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245071  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1545  amine oxidase  42.23 
 
 		 732 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.07 
 
 		 478 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.07 
 
 		 478 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.23 
 
 		 487 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.23 
 
 		 487 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  22.79 
 
 		 482 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  22.38 
 
 		 557 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 215 aa  49.7  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.08 
 
 		 490 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  25.68 
 
 		 473 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  22.79 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  22.47 
 
 		 463 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  22.79 
 
 		 482 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  22.79 
 
 		 482 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  21.9 
 
 		 454 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  22.94 
 
 		 490 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  42.17 
 
 		 349 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  39.44 
 
 		 494 aa  47.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.35 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  46.81 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.35 
 
 		 485 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 810 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  32 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  23.94 
 
 		 560 aa  44.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  48.78 
 
 		 488 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  47.83 
 
 		 482 aa  44.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  52.63 
 
 		 1073 aa  44.3  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  31.25 
 
 		 496 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>