224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5972 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  100 
 
 		 349 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  56.07 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  56.76 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  50.86 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  51.72 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  32.65 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  30.97 
 
 		 537 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  32.11 
 
 		 529 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  31.15 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  32.09 
 
 		 543 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  32.67 
 
 		 523 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  31.3 
 
 		 547 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  31.58 
 
 		 361 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  30.88 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  33.05 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  33.89 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  29.55 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  30.81 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  30.33 
 
 		 387 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  29.23 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  28.96 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  31.4 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  30.23 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  27.96 
 
 		 423 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  29.83 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  29.83 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  28.73 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  30.03 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  31.35 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  29.32 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  27.64 
 
 		 454 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  27.69 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  27.86 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.32 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.56 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  25.94 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.57 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.02 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.23 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  25.7 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  27.42 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.19 
 
 		 532 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  26.56 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  26.56 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 		 578 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  25.09 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  45.88 
 
 		 456 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.45 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.24 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  30.23 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.83 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  27.87 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.12 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  26.8 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  24.81 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25 
 
 		 463 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  25.62 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  24.38 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  25.09 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  35.24 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  26.92 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  42.11 
 
 		 469 aa  62.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  23.77 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  26.37 
 
 		 450 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  26.37 
 
 		 450 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  28.89 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.62 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.62 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  39.58 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  22.51 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  22.81 
 
 		 445 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  27.64 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  31.33 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  34.83 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  26.06 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.11 
 
 		 492 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  40.26 
 
 		 523 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  27.12 
 
 		 473 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  44.83 
 
 		 479 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  33.7 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  36.71 
 
 		 491 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  25 
 
 		 408 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  29.17 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.48 
 
 		 640 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  32.1 
 
 		 473 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  36 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  38.27 
 
 		 494 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  33.73 
 
 		 573 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  22.31 
 
 		 495 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 430 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1533  amine oxidase  39.56 
 
 		 682 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  22.41 
 
 		 438 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  23 
 
 		 415 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  35.9 
 
 		 466 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  35.9 
 
 		 466 aa  49.3  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  38.46 
 
 		 487 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.3 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.94 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  51.28 
 
 		 472 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>