237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5977 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  100 
 
 		 350 aa  725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  53.89 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  54.05 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  51.88 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  50.86 
 
 		 349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  31.99 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  32.09 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  28.29 
 
 		 543 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  28.3 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  31.11 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  30.49 
 
 		 547 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  29.33 
 
 		 529 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  31.73 
 
 		 378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  27.37 
 
 		 537 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  29.08 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  31.32 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  28.29 
 
 		 523 aa  149  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  31.37 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  29.36 
 
 		 367 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  26.55 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  29.14 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  30.75 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  29.05 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  29.05 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  29.86 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  29.4 
 
 		 521 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  27.2 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  24.82 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  29.46 
 
 		 456 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.92 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  29.84 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.83 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  27.08 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  27.08 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  26.67 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  30.27 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.02 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  27 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  26.52 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  29.73 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  24.24 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  27.54 
 
 		 498 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  25 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  28.1 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  25 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  25.32 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  25.1 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.75 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  24.36 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  24.89 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.12 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  24.18 
 
 		 499 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  25.54 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  26.02 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  25.32 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.07 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  26.69 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  43.42 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  29.65 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  23.11 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  28.19 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  43.59 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.83 
 
 		 498 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  29.66 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.83 
 
 		 498 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  36.36 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  36.36 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  33.33 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  31.73 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  26.07 
 
 		 487 aa  57  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  22.94 
 
 		 445 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  26.04 
 
 		 439 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  35.85 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  40.58 
 
 		 479 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  29.32 
 
 		 573 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  22.75 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  26.21 
 
 		 491 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  35.92 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.74 
 
 		 479 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  35.14 
 
 		 531 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  37.74 
 
 		 523 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  30.3 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 547 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  43.06 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  43.37 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  44.83 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  44.83 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  32.04 
 
 		 477 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  32.29 
 
 		 589 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  26.9 
 
 		 473 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  57.89 
 
 		 438 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  39.74 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1707  amine oxidase  35.16 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  30.11 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  36.26 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>