166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1328 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  100 
 
 		 531 aa  1077    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  42.31 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  38.5 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  38.5 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  38.59 
 
 		 527 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  37.43 
 
 		 535 aa  319  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  38.15 
 
 		 526 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  35.34 
 
 		 537 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  35.78 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  37.14 
 
 		 519 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  34.44 
 
 		 533 aa  302  9e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  36.36 
 
 		 532 aa  300  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  39.8 
 
 		 536 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  37.2 
 
 		 528 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  36.82 
 
 		 530 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  38.4 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  33.77 
 
 		 541 aa  283  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  36.97 
 
 		 535 aa  278  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  39.39 
 
 		 520 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  36.31 
 
 		 527 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  33.46 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  36.5 
 
 		 527 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  35.37 
 
 		 507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 		 529 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  28.09 
 
 		 638 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  28.89 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  28.63 
 
 		 478 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  28.11 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25.65 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.88 
 
 		 487 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.65 
 
 		 487 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  25.55 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.26 
 
 		 490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.05 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 485 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 490 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.91 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  26.57 
 
 		 646 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.87 
 
 		 478 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.87 
 
 		 478 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.2 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.2 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.85 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.2 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.9 
 
 		 482 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.55 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.49 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  26.98 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  25.24 
 
 		 564 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  29.27 
 
 		 418 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  22.9 
 
 		 573 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  27.27 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  22.91 
 
 		 698 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  25.91 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  27.36 
 
 		 624 aa  63.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.1 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.53 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.64 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  25.1 
 
 		 570 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  33.33 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  24.23 
 
 		 560 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  24.71 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  24.23 
 
 		 560 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  24.81 
 
 		 580 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  23.12 
 
 		 576 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  24.18 
 
 		 578 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  23.46 
 
 		 459 aa  54.7  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  35.14 
 
 		 350 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  33.06 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  24.43 
 
 		 560 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  40.19 
 
 		 444 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  32.79 
 
 		 623 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  48.08 
 
 		 463 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  23.21 
 
 		 560 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1661  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  57.89 
 
 		 648 aa  50.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.950377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  23.03 
 
 		 544 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  44.07 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.89 
 
 		 496 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.17 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  47.83 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  22.9 
 
 		 559 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  23.05 
 
 		 560 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  32.32 
 
 		 495 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  48.08 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  28.81 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2184  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.96 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.544077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  32.4 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  60.53 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.49 
 
 		 648 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.06 
 
 		 691 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  hitchhiker  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  48.98 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 369 aa  47.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  44.83 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>