182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2873 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  100 
 
 		 646 aa  1344    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  56.03 
 
 		 644 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  30.82 
 
 		 638 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  27.76 
 
 		 541 aa  196  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  28.66 
 
 		 527 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  27.63 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  28.36 
 
 		 535 aa  191  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  28.11 
 
 		 527 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  28.67 
 
 		 529 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  27.56 
 
 		 519 aa  189  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  27.1 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  27.44 
 
 		 532 aa  188  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  27.87 
 
 		 507 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  29.41 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 		 526 aa  184  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  26.61 
 
 		 516 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  27.09 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  28 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  27.03 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  26.09 
 
 		 533 aa  181  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  26.96 
 
 		 530 aa  170  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  27.63 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  28.6 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  26.42 
 
 		 528 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  25.57 
 
 		 557 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  27.11 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  28.27 
 
 		 535 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.35 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.35 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.35 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.21 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.35 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.17 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.5 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.05 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.86 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.82 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  22.95 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  27.82 
 
 		 418 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  22.22 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.16 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  26.1 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  22.16 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  21.72 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  22.16 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  29.7 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  40.43 
 
 		 495 aa  52.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  38.2 
 
 		 496 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  24.21 
 
 		 572 aa  52  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.78 
 
 		 647 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  35.14 
 
 		 645 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  47.17 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  29.09 
 
 		 491 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 769 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  51.16 
 
 		 478 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  51.16 
 
 		 478 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  26.76 
 
 		 573 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1173  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.72 
 
 		 990 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.461948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  36.71 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  35.06 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  21.93 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  47.92 
 
 		 480 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.88 
 
 		 647 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.88 
 
 		 647 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  38.57 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  51.06 
 
 		 456 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  51.11 
 
 		 491 aa  47.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  35.06 
 
 		 482 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 		 488 aa  47.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  47.73 
 
 		 436 aa  47.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  47.73 
 
 		 436 aa  47.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  48.89 
 
 		 488 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  50 
 
 		 436 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  54.76 
 
 		 462 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  56.1 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  48.89 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  48.78 
 
 		 565 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.06 
 
 		 501 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  48.89 
 
 		 488 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.28 
 
 		 776 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  50 
 
 		 436 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  46.55 
 
 		 489 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  47.73 
 
 		 502 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  50 
 
 		 436 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  61.11 
 
 		 469 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  59.18 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.89 
 
 		 478 aa  47.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 577 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  33.77 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  47.5 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.08 
 
 		 784 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.73 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  47.73 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  57.89 
 
 		 454 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  51.11 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.08 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  55.26 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  38.6 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.26 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>