More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1603 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  65.19 
 
 		 487 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  65.13 
 
 		 489 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  65.11 
 
 		 484 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  64.79 
 
 		 487 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  74.58 
 
 		 479 aa  750    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  63.71 
 
 		 487 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  67.71 
 
 		 472 aa  675    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  64.02 
 
 		 484 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 480 aa  993    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  65.18 
 
 		 484 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  66 
 
 		 488 aa  642    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  65.52 
 
 		 485 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  64.93 
 
 		 489 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  65.59 
 
 		 484 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  68.75 
 
 		 473 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  65.79 
 
 		 484 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  64.31 
 
 		 487 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  63.32 
 
 		 488 aa  651    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  66 
 
 		 488 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  65.56 
 
 		 478 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  67.92 
 
 		 472 aa  681    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  66.19 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  66.67 
 
 		 477 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  64.11 
 
 		 488 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  64 
 
 		 492 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  65.73 
 
 		 487 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  62.1 
 
 		 488 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  61.2 
 
 		 492 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  64.92 
 
 		 488 aa  624  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  65.59 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  65.39 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  65.73 
 
 		 487 aa  618  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  65.19 
 
 		 488 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  65.19 
 
 		 488 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  65.59 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  65.59 
 
 		 488 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  65.59 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  62.1 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  61.37 
 
 		 488 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  61.52 
 
 		 491 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  61.6 
 
 		 492 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  63.78 
 
 		 487 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  64.19 
 
 		 488 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  63.98 
 
 		 488 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  64.19 
 
 		 488 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  63.78 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  63.78 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  63.78 
 
 		 488 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  60.12 
 
 		 491 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  63.78 
 
 		 506 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  59.92 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  59.92 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  59.18 
 
 		 477 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.57 
 
 		 488 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  58.76 
 
 		 477 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  61.08 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0476  glutamate synthase subunit beta  62.45 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.638304  normal  0.914259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  61.08 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1811  glutamate synthase subunit beta  60.66 
 
 		 476 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.88 
 
 		 491 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1172  glutamate synthase subunit beta  59.5 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  57.93 
 
 		 484 aa  552  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  54.1 
 
 		 500 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.88 
 
 		 482 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  56.5 
 
 		 491 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.66 
 
 		 471 aa  545  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.71 
 
 		 496 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  56.71 
 
 		 491 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.59 
 
 		 482 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  54.81 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  56.88 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.54 
 
 		 484 aa  528  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.6 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0055  glutamate synthase subunit beta  57.93 
 
 		 484 aa  521  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0050  glutamate synthase subunit beta  57.93 
 
 		 484 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  52.81 
 
 		 489 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  52.18 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4276  glutamate synthase subunit beta  57.32 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156086  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  55.17 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  51.77 
 
 		 489 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  51.56 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.38 
 
 		 489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.05 
 
 		 475 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  55.62 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.21 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  51.35 
 
 		 490 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.16 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.98 
 
 		 492 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  56.04 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.8 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.26 
 
 		 484 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.73 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.54 
 
 		 484 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.82 
 
 		 495 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.37 
 
 		 492 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  53 
 
 		 486 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.22 
 
 		 495 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.42 
 
 		 495 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.77 
 
 		 495 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  54.45 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>