103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1720 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 529 aa  1111    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  36.4 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  34.35 
 
 		 533 aa  307  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  34.09 
 
 		 537 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  35.93 
 
 		 527 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  36.5 
 
 		 527 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  35.9 
 
 		 507 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  33.97 
 
 		 519 aa  291  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  33.65 
 
 		 533 aa  286  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  33.46 
 
 		 524 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  32.04 
 
 		 541 aa  283  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  34.73 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  34.73 
 
 		 516 aa  276  8e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  34.46 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  32.36 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  30.96 
 
 		 535 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  32.57 
 
 		 530 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  32.08 
 
 		 527 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  32.57 
 
 		 528 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  32.47 
 
 		 535 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  30.94 
 
 		 557 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  32.8 
 
 		 520 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  31.54 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  30.6 
 
 		 536 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  26.72 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  28.67 
 
 		 646 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  26.87 
 
 		 644 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.29 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  27.33 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.46 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.08 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.08 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.53 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  26.89 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.32 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.66 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.65 
 
 		 478 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.2 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.2 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.2 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  26.32 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.42 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.35 
 
 		 485 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.57 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.99 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  27.45 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.93 
 
 		 490 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.16 
 
 		 487 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.84 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.35 
 
 		 523 aa  90.1  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  24.02 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  23.63 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  22.93 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  22.85 
 
 		 572 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  24.6 
 
 		 624 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  23.96 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  21.13 
 
 		 573 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  22.97 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  22.63 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  23.54 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  22.16 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  22.41 
 
 		 459 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  37.23 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  29.82 
 
 		 492 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  36.84 
 
 		 491 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  46.55 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.97 
 
 		 505 aa  47.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  29.06 
 
 		 504 aa  47  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  38.24 
 
 		 531 aa  47  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  28.92 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  34.15 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  35.06 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  31.19 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  39.08 
 
 		 644 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  59.46 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  50 
 
 		 616 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  60 
 
 		 353 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  50 
 
 		 619 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  35.19 
 
 		 532 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  50 
 
 		 619 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  34.07 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  40.74 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  32.35 
 
 		 523 aa  44.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  44.07 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  31.78 
 
 		 549 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  40.3 
 
 		 504 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  43.4 
 
 		 625 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  23.43 
 
 		 449 aa  43.9  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  35.37 
 
 		 623 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  29.81 
 
 		 647 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  32.08 
 
 		 480 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  29.81 
 
 		 647 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  38.57 
 
 		 494 aa  43.5  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  31.25 
 
 		 518 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  31.25 
 
 		 518 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  47.73 
 
 		 565 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>