168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2438 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  100 
 
 		 507 aa  1043    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  60.76 
 
 		 527 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  60.61 
 
 		 527 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  41.76 
 
 		 531 aa  359  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  35.9 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  33.79 
 
 		 527 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  34.25 
 
 		 524 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 		 526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  34.48 
 
 		 520 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  32.35 
 
 		 519 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  33.33 
 
 		 516 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  33.33 
 
 		 516 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  34.06 
 
 		 528 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  35.07 
 
 		 536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  33.2 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  35.32 
 
 		 531 aa  240  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  31.62 
 
 		 535 aa  239  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  31.48 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  30.83 
 
 		 533 aa  236  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  34.9 
 
 		 535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  31.33 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  32.32 
 
 		 530 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  30.75 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  28.13 
 
 		 557 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  27.87 
 
 		 646 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  28.69 
 
 		 644 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  26.51 
 
 		 638 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  29.94 
 
 		 492 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  28.51 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  28.25 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.15 
 
 		 478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 		 478 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  27.47 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.93 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.74 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.29 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  27.18 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.35 
 
 		 487 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.31 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.28 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.7 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.08 
 
 		 490 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.19 
 
 		 487 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.31 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.31 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.31 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  23.22 
 
 		 564 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  30.96 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  21.98 
 
 		 523 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  22.6 
 
 		 572 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  23.35 
 
 		 573 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.9 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.19 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.62 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  28.38 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  23.7 
 
 		 698 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  36.17 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.16 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  66.67 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  36.17 
 
 		 647 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.9 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  36.17 
 
 		 647 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  64.1 
 
 		 462 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.8 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.08 
 
 		 560 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  33.04 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  33.67 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  33.65 
 
 		 560 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  49.12 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  34.31 
 
 		 623 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  61.54 
 
 		 537 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  40.45 
 
 		 510 aa  51.2  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  32.14 
 
 		 560 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 421 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  33.7 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  33.7 
 
 		 559 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  56.76 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  36.79 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  41.33 
 
 		 454 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  61.54 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  24.15 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.86 
 
 		 784 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  55 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  62.5 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  41.51 
 
 		 647 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  30.91 
 
 		 565 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  20.7 
 
 		 528 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.34 
 
 		 525 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  56.41 
 
 		 445 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  55 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  51.72 
 
 		 465 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  58.97 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  57.14 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>