239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0521 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  68.61 
 
 
565 aa  707    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  71.52 
 
 
619 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  70.18 
 
 
625 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  70.61 
 
 
624 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  71.74 
 
 
619 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  68.41 
 
 
592 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  96.37 
 
 
496 aa  969    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  71.3 
 
 
616 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  998    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  65.72 
 
 
491 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.25 
 
 
454 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  27.68 
 
 
445 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  29.09 
 
 
459 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.04 
 
 
435 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.84 
 
 
469 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.65 
 
 
492 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.24 
 
 
491 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.93 
 
 
628 aa  101  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.12 
 
 
492 aa  99.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.35 
 
 
470 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  27.21 
 
 
444 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.01 
 
 
479 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  24.75 
 
 
528 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.57 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.03 
 
 
484 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.11 
 
 
456 aa  93.6  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  26.01 
 
 
487 aa  93.6  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  24.4 
 
 
525 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  25.55 
 
 
431 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  26.5 
 
 
427 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.53 
 
 
523 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  26.35 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  25.45 
 
 
468 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.78 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  23.96 
 
 
516 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 
578 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
494 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  22.61 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  22.48 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  21.76 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  24.7 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  25.9 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.67 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  26.73 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  26.73 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.26 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  26.46 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  26.91 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  25.96 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  24.89 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.1 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.78 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.4 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.33 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.54 
 
 
495 aa  77.4  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.68 
 
 
495 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  28.29 
 
 
458 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
482 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  28.11 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  24.59 
 
 
519 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.98 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  21.7 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.3 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.61 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  25.88 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.24 
 
 
482 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.55 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.55 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
482 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  26.87 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  25.95 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.7 
 
 
478 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.66 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.7 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  26.19 
 
 
507 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.7 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 
490 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.32 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.27 
 
 
449 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.88 
 
 
1199 aa  73.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  22.47 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  25.81 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.7 
 
 
487 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  23.25 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4445  amine oxidase  24.74 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  25.42 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.47 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  26.04 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  24.78 
 
 
494 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  25.61 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  23.43 
 
 
526 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  25.81 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  25.81 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  24.13 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  23.51 
 
 
510 aa  67  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  25.05 
 
 
465 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>