279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2710 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 469 aa  966    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  26.98 
 
 		 496 aa  132  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.23 
 
 		 491 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.88 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.88 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.71 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  26.01 
 
 		 478 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  26.29 
 
 		 495 aa  117  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.3 
 
 		 478 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.85 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  24.51 
 
 		 482 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.2 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  24.73 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.16 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.51 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.37 
 
 		 496 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.51 
 
 		 478 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.52 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  27.57 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.2 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  24.51 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.84 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.1 
 
 		 482 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.31 
 
 		 487 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.31 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.31 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.1 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.1 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.1 
 
 		 485 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.1 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  25.92 
 
 		 456 aa  97.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.23 
 
 		 619 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.23 
 
 		 619 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  23.79 
 
 		 624 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.68 
 
 		 445 aa  91.3  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.54 
 
 		 592 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.4 
 
 		 565 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  23.43 
 
 		 616 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  27.45 
 
 		 418 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  22.62 
 
 		 625 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  26.25 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  26.74 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  25.26 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.56 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  25.63 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  25.63 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.46 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  27.25 
 
 		 429 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.63 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.97 
 
 		 469 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  25.99 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  22.11 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  26.49 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.26 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.26 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25.86 
 
 		 624 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  22.35 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  27.29 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  24.23 
 
 		 573 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  25 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  25.83 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  23.29 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  25.6 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  25.6 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  27.65 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  24.47 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.22 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  22.84 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  24.4 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  24.36 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  23.49 
 
 		 487 aa  67  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.83 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  25.17 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  22.2 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.65 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.44 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  23.72 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  22.88 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  22.69 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  37.78 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  43.81 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  23.52 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  22.65 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  43.48 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  43.48 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  35.92 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  22.86 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  23.58 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  23.84 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  47.37 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  21.2 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  21.77 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  54.55 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  30.74 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  26.44 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.89 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  33.14 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>