287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4155 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  100 
 
 		 465 aa  905    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  36.87 
 
 		 431 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  31.35 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  32.16 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4436  amine oxidase  31.94 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4453  amine oxidase  32.94 
 
 		 443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  30.82 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  27.41 
 
 		 456 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  24.22 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  30.33 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  25.55 
 
 		 537 aa  97.8  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  28.41 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  28.41 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  25.63 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26.39 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.48 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  28.27 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  30.26 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  26.6 
 
 		 625 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  25.86 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.83 
 
 		 624 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  25.56 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.68 
 
 		 616 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  26.47 
 
 		 619 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.47 
 
 		 619 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.77 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  26.35 
 
 		 592 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.54 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  26.93 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  26.93 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  26.05 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.05 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.21 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.52 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  25.21 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  27.52 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  26.13 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.63 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  24.89 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  28.1 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.03 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.33 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.43 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.43 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  29.49 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  26.77 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.35 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  23.38 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  27.35 
 
 		 493 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  27.35 
 
 		 493 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  25.96 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  25.85 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.33 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.54 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  25.78 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  24.66 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  26.82 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  26.03 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  28.63 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  22.62 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  26.29 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  27.42 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  26.99 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  46.34 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  22.49 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  25.96 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25.68 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  28.24 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  25.55 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  20.82 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  25.57 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  24.59 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  26.98 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  22 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  31.4 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  49.21 
 
 		 589 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  20.76 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  52.73 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  45.45 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.19 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  34.96 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  30.8 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  58 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  35.77 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 		 474 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  24 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  25.39 
 
 		 510 aa  53.5  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  43.75 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  25.63 
 
 		 1199 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  44.64 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  44.64 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  36.56 
 
 		 365 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  29.54 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  20.79 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  50 
 
 		 547 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  51.85 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>