173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4356 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  100 
 
 
493 aa  994    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  72.82 
 
 
492 aa  716    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  98.17 
 
 
493 aa  979    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  98.17 
 
 
493 aa  979    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  63.5 
 
 
494 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  58.9 
 
 
490 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  63.49 
 
 
578 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  63.27 
 
 
494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  61.76 
 
 
493 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  63.49 
 
 
494 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  58.54 
 
 
532 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  59.19 
 
 
498 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  59.19 
 
 
498 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  60.76 
 
 
498 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  39.41 
 
 
465 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36.97 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  38.9 
 
 
459 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  39.05 
 
 
450 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  39.05 
 
 
450 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  37.05 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  39.56 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  39.09 
 
 
499 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  36.62 
 
 
457 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  38.98 
 
 
449 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  36.95 
 
 
456 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  36.09 
 
 
492 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  38.13 
 
 
439 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  37 
 
 
484 aa  217  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  34.22 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  35.04 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  34.41 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  32.31 
 
 
459 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  34.71 
 
 
452 aa  194  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  35.41 
 
 
462 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  35.6 
 
 
463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  37.61 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  34.68 
 
 
444 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  30.5 
 
 
487 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  30.15 
 
 
464 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  29.87 
 
 
469 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  32.2 
 
 
512 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  30.88 
 
 
510 aa  146  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  32.82 
 
 
445 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  26.36 
 
 
457 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  32.05 
 
 
438 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  30.47 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  26.67 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  30.74 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  25.66 
 
 
436 aa  83.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  23.09 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  30.94 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  25.27 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  29.37 
 
 
543 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.74 
 
 
479 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  25.73 
 
 
435 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  30.94 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  28.22 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  30.54 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  22.56 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  28.88 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.81 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  26.23 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  26.53 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.59 
 
 
496 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  29.96 
 
 
523 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  40.77 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  29.03 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  30.77 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  30.74 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  30.77 
 
 
387 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  24.41 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  29.3 
 
 
378 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  25.48 
 
 
365 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  30.41 
 
 
381 aa  63.9  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  24.3 
 
 
495 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.31 
 
 
592 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  50.62 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 
492 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  27.6 
 
 
353 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  27.98 
 
 
465 aa  61.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  27.38 
 
 
368 aa  60.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  39.8 
 
 
387 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  30.45 
 
 
529 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  39.8 
 
 
387 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  27.62 
 
 
521 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  22.51 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  25.17 
 
 
463 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  23.38 
 
 
625 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  49.06 
 
 
378 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  22.51 
 
 
516 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  21.49 
 
 
528 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  24.15 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  21.77 
 
 
525 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.81 
 
 
495 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.04 
 
 
565 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.24 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  34.57 
 
 
557 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  27.73 
 
 
429 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>