239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  68.01 
 
 
565 aa  705    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  71.3 
 
 
619 aa  702    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  69.74 
 
 
625 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  70.18 
 
 
624 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  67.81 
 
 
592 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  70.87 
 
 
616 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  999    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  71.52 
 
 
619 aa  703    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  96.37 
 
 
496 aa  969    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  64.1 
 
 
491 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  27.23 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.03 
 
 
454 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  29.31 
 
 
459 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  28.26 
 
 
435 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  25.37 
 
 
469 aa  107  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.83 
 
 
491 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.92 
 
 
492 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.93 
 
 
628 aa  100  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  24.56 
 
 
479 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  24.8 
 
 
528 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  26.07 
 
 
492 aa  97.1  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  25.9 
 
 
470 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.94 
 
 
456 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  26.64 
 
 
444 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  24.31 
 
 
525 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.03 
 
 
484 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  26.78 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  26.58 
 
 
487 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  26.73 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  27.18 
 
 
459 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.43 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.7 
 
 
478 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  22.34 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  22.54 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  24.67 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  24.27 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.86 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  22.63 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.56 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  22.54 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.75 
 
 
523 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  23.42 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.13 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  26.73 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  26.73 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  25 
 
 
468 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  26.19 
 
 
452 aa  80.1  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  26.04 
 
 
465 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
494 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  26.27 
 
 
493 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 
578 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.23 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.46 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  25.77 
 
 
532 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  26.46 
 
 
494 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25.67 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  27.38 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.1 
 
 
478 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 
478 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  25.5 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  24.68 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.24 
 
 
482 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.38 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
487 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
482 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.47 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.49 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.87 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  24.73 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.76 
 
 
1199 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  21.7 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  24.19 
 
 
519 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  23.15 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.08 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  25.95 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.95 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  24.01 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  26.75 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  25.44 
 
 
499 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 
490 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  25.76 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.27 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  25.26 
 
 
492 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  22.77 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  25.59 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  22.7 
 
 
510 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.89 
 
 
496 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  25.32 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  23.59 
 
 
494 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4445  amine oxidase  23.78 
 
 
487 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  24.81 
 
 
1274 aa  66.6  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  25.4 
 
 
459 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  25.59 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  23.29 
 
 
418 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  24.52 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  25.59 
 
 
493 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>