More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1319 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  100 
 
 
470 aa  956    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  96.6 
 
 
468 aa  876    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  44.84 
 
 
479 aa  382  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  42.55 
 
 
466 aa  349  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  40.83 
 
 
435 aa  315  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  38.27 
 
 
445 aa  292  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  37.21 
 
 
495 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  36.98 
 
 
495 aa  266  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  37.38 
 
 
445 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  35.38 
 
 
436 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  37.5 
 
 
481 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  37.74 
 
 
427 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  32.21 
 
 
463 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  31.08 
 
 
628 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  30.26 
 
 
418 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  32.33 
 
 
1199 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  33.95 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  33.9 
 
 
1274 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  31.38 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  35.44 
 
 
999 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  31.48 
 
 
429 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  30.73 
 
 
446 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  28.17 
 
 
657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  28.81 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.58 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  28.47 
 
 
420 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.21 
 
 
625 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  30.15 
 
 
417 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.9 
 
 
496 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  28.6 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.5 
 
 
624 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  25.76 
 
 
577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.05 
 
 
592 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  28.33 
 
 
480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  30.41 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  26.71 
 
 
536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  28.82 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  27.05 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  27.94 
 
 
415 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  27.79 
 
 
425 aa  113  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  30.4 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  26.76 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.22 
 
 
619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.06 
 
 
616 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  27.98 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.22 
 
 
619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  28.12 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  27.21 
 
 
436 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  23.59 
 
 
565 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  29 
 
 
422 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  28.16 
 
 
409 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  27.85 
 
 
414 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  28.87 
 
 
422 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  28.08 
 
 
451 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  28.67 
 
 
419 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  28.67 
 
 
413 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  27.27 
 
 
442 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  28.1 
 
 
442 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  27.96 
 
 
450 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.16 
 
 
422 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  26.21 
 
 
449 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  27.36 
 
 
423 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.95 
 
 
447 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.09 
 
 
456 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  28.25 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.48 
 
 
494 aa  95.1  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  27.36 
 
 
430 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  26.33 
 
 
438 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  26.76 
 
 
463 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 
476 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  25.11 
 
 
459 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  26.96 
 
 
484 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  25.19 
 
 
504 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  26.09 
 
 
423 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  24.46 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.68 
 
 
482 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  27.99 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  23.53 
 
 
491 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.68 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.68 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.68 
 
 
487 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  25.85 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  25.74 
 
 
476 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  28.32 
 
 
446 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  25.79 
 
 
420 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.84 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  26.24 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 
490 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.53 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.68 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  24.48 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  24.89 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  26.32 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  22.38 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  28.04 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  28.04 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 
469 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  23.41 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>