More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2278 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  100 
 
 		 435 aa  857    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  73.78 
 
 		 445 aa  623  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  41.69 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  40.83 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  39.91 
 
 		 468 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  38.48 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  34.43 
 
 		 445 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  35.19 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  35.5 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  35.03 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  40.38 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  37.85 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  34.88 
 
 		 481 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  33.48 
 
 		 628 aa  199  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  34.55 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  33.26 
 
 		 1199 aa  179  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  39.03 
 
 		 1274 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  33.87 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  32.27 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  32.42 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  31.35 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  33.84 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  31.76 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  33.25 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  33.66 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  32.16 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  32.77 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  30.44 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  32.44 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  28.14 
 
 		 494 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  25.05 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  27.23 
 
 		 536 aa  123  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  31.67 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  36.73 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  31.46 
 
 		 442 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  33.1 
 
 		 429 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  34.67 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  29.15 
 
 		 422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  30.96 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  32.3 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  36.93 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  33.08 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  27.47 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  33.56 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  33.17 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  29.02 
 
 		 425 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  31.7 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  30.3 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  36.95 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  29.28 
 
 		 657 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  28.26 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  28.04 
 
 		 496 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  30.71 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  29.9 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  29.59 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.97 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  27.8 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.23 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  30.48 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  29.06 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  33.08 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  32.25 
 
 		 999 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  29.76 
 
 		 449 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  30.32 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  30.55 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  27.01 
 
 		 625 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  29.28 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  26.55 
 
 		 565 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  29.24 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  29.83 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  27.46 
 
 		 480 aa  94  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.11 
 
 		 592 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  29.83 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  32.29 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  27.01 
 
 		 624 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  27.04 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.08 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  26.39 
 
 		 616 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  28.17 
 
 		 444 aa  90.1  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 476 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  26.16 
 
 		 619 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  26.96 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  24.62 
 
 		 525 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  24.4 
 
 		 528 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.94 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.47 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.6 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  30.45 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  30.45 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  30.91 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  25.99 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48603  flavin-containing amine oxidase  27.84 
 
 		 600 aa  83.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.871635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  27.43 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  27.03 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  28.12 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  27.14 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  29.72 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.89 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  30.94 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>