178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1379 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  100 
 
 
528 aa  1090    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  44.08 
 
 
527 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  45.04 
 
 
524 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  40.34 
 
 
516 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  40.54 
 
 
516 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  39.58 
 
 
533 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  40.65 
 
 
526 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  43.02 
 
 
519 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  40.68 
 
 
533 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  39.66 
 
 
537 aa  385  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  41.86 
 
 
535 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  40.99 
 
 
530 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  39.92 
 
 
532 aa  361  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  38.9 
 
 
541 aa  352  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  38.43 
 
 
536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  37.9 
 
 
531 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  37.19 
 
 
531 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  38.05 
 
 
520 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  36.04 
 
 
527 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  36.28 
 
 
527 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  36.38 
 
 
535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  32.57 
 
 
529 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  34.06 
 
 
507 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  32.05 
 
 
557 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  29.41 
 
 
638 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  29.68 
 
 
492 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  27.42 
 
 
478 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  27.68 
 
 
644 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  29.03 
 
 
490 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  29.45 
 
 
487 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  29.13 
 
 
485 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  29.07 
 
 
482 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  29.07 
 
 
487 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  29.07 
 
 
482 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  28.97 
 
 
487 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 
490 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  28.72 
 
 
490 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  28.07 
 
 
478 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  28.87 
 
 
482 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  26.42 
 
 
646 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  29.38 
 
 
491 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  27.03 
 
 
478 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  27.03 
 
 
478 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  33.74 
 
 
418 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  26.27 
 
 
478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  26.48 
 
 
478 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  26.9 
 
 
478 aa  136  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  27.64 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  26.27 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  26.27 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  26.76 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.64 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  26.13 
 
 
503 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.2 
 
 
523 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  28.69 
 
 
624 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  25.33 
 
 
525 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  26.86 
 
 
685 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.58 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  25.05 
 
 
528 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.31 
 
 
496 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  25.39 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.49 
 
 
496 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  28.69 
 
 
564 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  21.16 
 
 
698 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  26.5 
 
 
572 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  24.4 
 
 
444 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.09 
 
 
454 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25.35 
 
 
619 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  33.94 
 
 
573 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  22.57 
 
 
469 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.07 
 
 
616 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.29 
 
 
565 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  23.19 
 
 
496 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  25.07 
 
 
619 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.38 
 
 
495 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.98 
 
 
624 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.2 
 
 
560 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.2 
 
 
560 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  25.1 
 
 
449 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  23.22 
 
 
492 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  25.37 
 
 
1199 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.35 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  23.21 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  33.93 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  24.89 
 
 
481 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.65 
 
 
625 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  21.75 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  44.59 
 
 
736 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  44.07 
 
 
474 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  40.23 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  22.51 
 
 
560 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  25.36 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  25 
 
 
484 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  32.73 
 
 
438 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  28.21 
 
 
530 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  52.17 
 
 
442 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  34 
 
 
565 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  31.96 
 
 
623 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0790  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  35.21 
 
 
700 aa  47.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  31.48 
 
 
576 aa  47.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>