129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1245 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  100 
 
 		 575 aa  1153    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  43.3 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  44.67 
 
 		 563 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  42.39 
 
 		 562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  38.81 
 
 		 723 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  29.1 
 
 		 565 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  29.37 
 
 		 580 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  30.24 
 
 		 576 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  29.44 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  29.44 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  29.66 
 
 		 560 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  28.93 
 
 		 560 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  29.95 
 
 		 578 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  26.83 
 
 		 570 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  29.23 
 
 		 572 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  29.4 
 
 		 544 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  27.29 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  29.16 
 
 		 560 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  29.4 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  28.15 
 
 		 623 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  27.63 
 
 		 556 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  28.51 
 
 		 649 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  24.28 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  23.92 
 
 		 803 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  26.58 
 
 		 644 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.05 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.32 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  24.32 
 
 		 482 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  24.32 
 
 		 482 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  24.32 
 
 		 485 aa  93.6  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  24.32 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.12 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.54 
 
 		 487 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.12 
 
 		 490 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.56 
 
 		 487 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.8 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  25.09 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  25.71 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.73 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  22.85 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  22.87 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.96 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  24.83 
 
 		 572 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  22.91 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  22.85 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.5 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  22.91 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  22.59 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.79 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3151  putative tryptophan 2-monooxygenase oxidoreductase protein  22.78 
 
 		 707 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453047  normal  0.0453097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  44.74 
 
 		 564 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  43.48 
 
 		 157 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  36.63 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.87 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.87 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  35.92 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  35 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  35.92 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  22.65 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  23.21 
 
 		 685 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  22.48 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  42.11 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  33.09 
 
 		 492 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  21.48 
 
 		 638 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  21.65 
 
 		 524 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  22.22 
 
 		 541 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  21.33 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  26.32 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  42.11 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  33.93 
 
 		 528 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  23.43 
 
 		 419 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  21.63 
 
 		 530 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.43 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  22.85 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  33 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  33.65 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  36 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  36 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  26.11 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  38.54 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  36 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  36.46 
 
 		 492 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 539 aa  47.8  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  36 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.15 
 
 		 432 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  36 
 
 		 498 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1930  hypothetical protein  34.72 
 
 		 87 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  21.93 
 
 		 496 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  37.5 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  32.22 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  37.18 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  34.55 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  34.04 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  39.39 
 
 		 532 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  40.51 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  34.26 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  40.51 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  40.51 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>