68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1175 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  100 
 
 		 644 aa  1341    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  72.44 
 
 		 157 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  25.79 
 
 		 562 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  25.9 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  25.12 
 
 		 563 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  23.31 
 
 		 578 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4255  hypothetical protein  82.46 
 
 		 74 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  26.58 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  22.93 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  23.46 
 
 		 560 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  22.84 
 
 		 723 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.87 
 
 		 560 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  22.31 
 
 		 560 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.87 
 
 		 560 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  21.83 
 
 		 560 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  24.07 
 
 		 649 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  23.58 
 
 		 580 aa  92  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  23.86 
 
 		 570 aa  90.9  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  23.88 
 
 		 623 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  23.75 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  22.07 
 
 		 559 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  22.08 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  23.62 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  21.74 
 
 		 803 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  26.29 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  23.01 
 
 		 566 aa  54.3  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  31.65 
 
 		 491 aa  53.9  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.09 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  35.78 
 
 		 482 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  29.2 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  38.38 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  36.47 
 
 		 698 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  27.04 
 
 		 523 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  28.47 
 
 		 490 aa  48.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  28.47 
 
 		 487 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  33.03 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  28.47 
 
 		 482 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  28.47 
 
 		 482 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  33.03 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  28.47 
 
 		 482 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  28.47 
 
 		 490 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  30.84 
 
 		 490 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  33.94 
 
 		 478 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  33.94 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  33.94 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  33.94 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  33.94 
 
 		 478 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  36.71 
 
 		 527 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  30.84 
 
 		 485 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  34.94 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  48.94 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  41.56 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  33.94 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  37.5 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  37.65 
 
 		 573 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  39.08 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  48.94 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  33.94 
 
 		 478 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  44.62 
 
 		 495 aa  45.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 		 536 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  27.74 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  48.98 
 
 		 646 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  32.91 
 
 		 507 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  24.14 
 
 		 418 aa  44.3  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 383 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 351 aa  44.3  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  48.78 
 
 		 498 aa  43.9  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  34.18 
 
 		 527 aa  43.9  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>