More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2933 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 383 aa  781    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  76.75 
 
 		 358 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  63.95 
 
 		 351 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  63.34 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  63.64 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  61.78 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  65.31 
 
 		 369 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  52.29 
 
 		 407 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  40.97 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 314 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  40.62 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  38.29 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  38.57 
 
 		 355 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 313 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  35.92 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  35.31 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  33.79 
 
 		 843 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  35.45 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  35.06 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  34.6 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  34.9 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  34.9 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  34.29 
 
 		 329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 328 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 329 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  29.64 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  30.95 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  33.82 
 
 		 320 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  29.33 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  33.23 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  29.66 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 346 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  30.36 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  25.36 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  28.99 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  27.83 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  29.79 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  28.45 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  26.72 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.74 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  27.87 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  29.08 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  40.91 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  53.7 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  34.65 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 		 686 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  45.28 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  43.75 
 
 		 647 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  43.75 
 
 		 647 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.31 
 
 		 686 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  44 
 
 		 502 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  44 
 
 		 502 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  43.4 
 
 		 428 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  43.55 
 
 		 467 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  25.82 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92705  predicted protein  24.54 
 
 		 365 aa  49.7  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  46.77 
 
 		 670 aa  49.7  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4782  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.23 
 
 		 686 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  44.93 
 
 		 670 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  32.46 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  27.93 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.54 
 
 		 677 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.810441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3639  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.54 
 
 		 677 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.664149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  40.91 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  44.23 
 
 		 686 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  34.02 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2296  hypothetical protein  33.66 
 
 		 674 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2269  hypothetical protein  33.66 
 
 		 674 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  46.67 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  47.92 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  44.23 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2193  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.16 
 
 		 645 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000298441  normal  0.0270911 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  36.51 
 
 		 499 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 		 441 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  45.28 
 
 		 474 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  41.1 
 
 		 451 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1865  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  42.31 
 
 		 687 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.715282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 		 516 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>