131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1126 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  100 
 
 		 328 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  93.9 
 
 		 328 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  76.76 
 
 		 328 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  78.29 
 
 		 328 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  73.78 
 
 		 328 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  71.56 
 
 		 327 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  72.87 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  72.56 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  70.95 
 
 		 327 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  71.95 
 
 		 328 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  68.1 
 
 		 329 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  38.53 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  35.82 
 
 		 843 aa  185  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  38.51 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  37.24 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  33.13 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  32.93 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  35.31 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  34.37 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 407 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 367 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 360 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  30.28 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  27.9 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  29.47 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  31.23 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  31.1 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  29.61 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.09 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  24.93 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  26.9 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.8 
 
 		 389 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.74 
 
 		 413 aa  89.4  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.29 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.23 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  25.57 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  26.49 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  23.36 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  44 
 
 		 502 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  44 
 
 		 502 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  23.97 
 
 		 484 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  42.37 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  34.74 
 
 		 477 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  38.89 
 
 		 488 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  45.28 
 
 		 482 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 		 485 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 		 482 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 		 482 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  37.14 
 
 		 512 aa  46.6  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 		 490 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 		 487 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  53.85 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  33.77 
 
 		 477 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  45.28 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  33.77 
 
 		 477 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  40 
 
 		 488 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  25.81 
 
 		 381 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  41.82 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  38.98 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  45.28 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  35.62 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  42.11 
 
 		 486 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  41.82 
 
 		 488 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  38.6 
 
 		 499 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1453  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.42 
 
 		 1067 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  40.68 
 
 		 493 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  33.71 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  38.6 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  38.6 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  34.29 
 
 		 495 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  36.49 
 
 		 484 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>