47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0625 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 413 aa  858    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  48.47 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  27.75 
 
 		 843 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 328 aa  106  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  25.39 
 
 		 327 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  25.13 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  26.41 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  26.85 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  25.58 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 333 aa  89.7  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 354 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  24.74 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  26.22 
 
 		 343 aa  86.7  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  24.67 
 
 		 328 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.93 
 
 		 328 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  24.6 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  23.91 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  24.28 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  25.43 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  21.8 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  21.56 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  22.22 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 369 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  26.72 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  27.03 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  20.41 
 
 		 319 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>