118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0886 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  100 
 
 		 329 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  41.3 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  41.25 
 
 		 332 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  40.18 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  35.71 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  38.12 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  34.78 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  35.09 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 329 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  35.26 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  35.26 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  37.79 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  34.94 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  35.71 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  35.74 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  33.04 
 
 		 843 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  33.23 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  32.42 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.7 
 
 		 381 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  23.96 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  30.58 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.23 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  27.5 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  28.79 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  23.91 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  30.6 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  25.62 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  24.2 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  26.22 
 
 		 523 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32874  predicted protein  27.76 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.95 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  28.24 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  26.36 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  23.31 
 
 		 439 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  27.27 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  31.72 
 
 		 506 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  38.71 
 
 		 598 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  40 
 
 		 509 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.22 
 
 		 472 aa  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  31.43 
 
 		 512 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  31.43 
 
 		 512 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  37.93 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  37.5 
 
 		 503 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  41.54 
 
 		 571 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  23.91 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  31.43 
 
 		 512 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  42.03 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  37.68 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  41.82 
 
 		 507 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  29.51 
 
 		 436 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  38.98 
 
 		 504 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  22.77 
 
 		 509 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  34.07 
 
 		 503 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  35.71 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  37.25 
 
 		 502 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  37.25 
 
 		 502 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  35.48 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.81 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  38.18 
 
 		 448 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  37.97 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  36.11 
 
 		 503 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3831  amine oxidase  33.05 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  30.77 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 516 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  41.67 
 
 		 507 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  39.62 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  36.36 
 
 		 470 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  34.85 
 
 		 506 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  22.86 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  42.86 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>