140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0536 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
342 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  98.54 
 
 
342 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  96.2 
 
 
342 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.83 
 
 
359 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
346 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
354 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
361 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  31.44 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
383 aa  89.7  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  32.24 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  32.45 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.07 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  30.58 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  32.02 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  29.22 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  30.15 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  28.02 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  28.32 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  29.38 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  29.08 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  31 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  28.32 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.94 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  29.91 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  28.46 
 
 
843 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  26.14 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.51 
 
 
328 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  26.2 
 
 
328 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  50 
 
 
479 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  36.99 
 
 
434 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  25 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  46.67 
 
 
438 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  36.36 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  41.18 
 
 
484 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  41.18 
 
 
245 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  44 
 
 
476 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  41.33 
 
 
426 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  25.84 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.16 
 
 
450 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.16 
 
 
450 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  43.94 
 
 
451 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
510 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  43.06 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  46.43 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  45.45 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  30.46 
 
 
2162 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  40 
 
 
418 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  34.04 
 
 
459 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  42.47 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  29.63 
 
 
599 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  44.62 
 
 
448 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  33.33 
 
 
465 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  44.59 
 
 
420 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.91 
 
 
474 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  49.06 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  31.91 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  36.67 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  44.64 
 
 
445 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  31.91 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  31.91 
 
 
473 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  31.91 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  31.91 
 
 
471 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  28.48 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  45.1 
 
 
383 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  35.59 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
554 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  40.3 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  41.43 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  34.25 
 
 
468 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  42.59 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  40.68 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  32.43 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  39.29 
 
 
507 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  40.98 
 
 
460 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  31.91 
 
 
472 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  31.46 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.97 
 
 
501 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  32.98 
 
 
479 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>