More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03741 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  75.25 
 
 		 509 aa  823    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  77.01 
 
 		 509 aa  834    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  75.83 
 
 		 509 aa  823    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 509 aa  1032    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  57.37 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  56.78 
 
 		 509 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  51.57 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  51.38 
 
 		 510 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  48.51 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  43.25 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  42.77 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  40.64 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  40.34 
 
 		 595 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  35.63 
 
 		 598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  35.35 
 
 		 645 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 497 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  36 
 
 		 513 aa  312  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 		 502 aa  303  5.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  34.33 
 
 		 633 aa  271  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  32.3 
 
 		 530 aa  265  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  33.99 
 
 		 635 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  32.39 
 
 		 504 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  30.77 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  30.77 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  31.18 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  30.95 
 
 		 506 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  33.07 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  31.83 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  32.34 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  32.55 
 
 		 514 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  29.8 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  32.6 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  31.59 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  29.65 
 
 		 518 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  31.46 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 532 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  27.95 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  29.13 
 
 		 508 aa  194  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  30.83 
 
 		 503 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  28.65 
 
 		 518 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  27.31 
 
 		 522 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  28.09 
 
 		 504 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  28.4 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.34 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.38 
 
 		 938 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.33 
 
 		 493 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.71 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.97 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  23.85 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  23.67 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  24.9 
 
 		 498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.28 
 
 		 740 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.78 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.58 
 
 		 511 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.77 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  23.77 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  23.65 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  23.08 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.67 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  22.81 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  24.76 
 
 		 489 aa  103  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  24.55 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  24.03 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  24.77 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 520 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.82 
 
 		 544 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 717 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  25.95 
 
 		 708 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  24.12 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  21.9 
 
 		 520 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27 
 
 		 711 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 555 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 		 554 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  25.24 
 
 		 504 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 484 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.21 
 
 		 501 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  24.02 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  26.65 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  26.61 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  29.17 
 
 		 546 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  21.48 
 
 		 534 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  22.91 
 
 		 923 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 554 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  23.32 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  22.54 
 
 		 504 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  21.95 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.83 
 
 		 542 aa  91.3  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 519 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>