78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1276 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 340 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  26.1 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  27.55 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  25.79 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.4 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  30.75 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  31.83 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  28.26 
 
 		 328 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  29.91 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  26.87 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  32.98 
 
 		 843 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  25.88 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  25.24 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.56 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  31.29 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  30.21 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  26.96 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  28.97 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  29.38 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.85 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  26.97 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.91 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  24.58 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  21.71 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  48.28 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  55.36 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  20.75 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  42.67 
 
 		 523 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1404  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 		 613 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.628111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  30.63 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  36.76 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  46.81 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  38.1 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  46.15 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  38.98 
 
 		 490 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  41.51 
 
 		 938 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  39.66 
 
 		 487 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  38.98 
 
 		 485 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  24.06 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  42.86 
 
 		 502 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  42.86 
 
 		 502 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  38.98 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  38.98 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  38.98 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  41.38 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  38.18 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  40 
 
 		 570 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 891 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0457  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.04 
 
 		 613 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000895922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  29.23 
 
 		 426 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  36.76 
 
 		 410 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2335  2,4-dienoyl-CoA reductase  52.17 
 
 		 677 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1284  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.43 
 
 		 613 aa  42.4  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000566158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>