More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03731 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  100 
 
 
938 aa  1942    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  31.76 
 
 
512 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  31.76 
 
 
512 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  30.96 
 
 
506 aa  254  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  31.35 
 
 
504 aa  249  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  29.29 
 
 
520 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  29.34 
 
 
520 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  29.92 
 
 
520 aa  244  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  31.64 
 
 
507 aa  243  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  30.44 
 
 
516 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  30.97 
 
 
522 aa  241  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  28.96 
 
 
518 aa  237  8e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
532 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
506 aa  233  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  28.79 
 
 
518 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
503 aa  231  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  31.18 
 
 
508 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  29.69 
 
 
503 aa  221  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  30.81 
 
 
503 aa  221  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  29.9 
 
 
508 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  27.57 
 
 
514 aa  208  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  27.57 
 
 
514 aa  208  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  28.04 
 
 
514 aa  204  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  27.57 
 
 
514 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  29.38 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  30.1 
 
 
499 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  27.71 
 
 
513 aa  179  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  31.35 
 
 
505 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
506 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 
502 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
501 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  30.45 
 
 
504 aa  166  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  30.13 
 
 
499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  30.33 
 
 
499 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  30.31 
 
 
517 aa  164  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  26.82 
 
 
645 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
515 aa  162  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
497 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
497 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  30.22 
 
 
523 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 
512 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  28.43 
 
 
510 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  26.38 
 
 
512 aa  144  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 
512 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  26.38 
 
 
509 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  26 
 
 
554 aa  140  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  26.23 
 
 
509 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  26.23 
 
 
509 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
547 aa  138  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  27.36 
 
 
509 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  27.96 
 
 
509 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2425  putative oxidoreductase  27.34 
 
 
413 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2421  putative oxidoreductase  27.6 
 
 
413 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.70845  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  27.34 
 
 
413 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2533  putative oxidoreductase  26.44 
 
 
413 aa  128  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0200812  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  26.84 
 
 
598 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  26.74 
 
 
658 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2376  putative oxidoreductase  25.84 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  23.67 
 
 
505 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.75 
 
 
511 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1310  putative oxidoreductase  26.01 
 
 
413 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.78 
 
 
544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  27.18 
 
 
489 aa  119  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  27.65 
 
 
708 aa  119  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  26.12 
 
 
595 aa  118  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.43 
 
 
507 aa  118  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  25.42 
 
 
1385 aa  118  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  25.95 
 
 
412 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.69 
 
 
508 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  22.66 
 
 
504 aa  117  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  25.39 
 
 
508 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  24.27 
 
 
511 aa  117  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
717 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1200  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.16 
 
 
473 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.95 
 
 
511 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0366  putative oxidoreductase  24.27 
 
 
500 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  24.02 
 
 
480 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.12 
 
 
511 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  26.62 
 
 
711 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  24.52 
 
 
530 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  23.92 
 
 
1150 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  24.49 
 
 
493 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  30.33 
 
 
447 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  24.24 
 
 
480 aa  115  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  25.3 
 
 
445 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.41 
 
 
511 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 
440 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  26.45 
 
 
653 aa  115  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 
510 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  24.94 
 
 
485 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  25.7 
 
 
412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.57 
 
 
445 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.7 
 
 
412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  25.7 
 
 
412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  25.7 
 
 
412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  24.14 
 
 
445 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  24.47 
 
 
469 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  24.14 
 
 
445 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  24.71 
 
 
482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0297  putative oxidoreductase  24.13 
 
 
498 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.284933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>