102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1154 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  33.73 
 
 
327 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  33.14 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  31.1 
 
 
328 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
314 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  28.92 
 
 
324 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  30.98 
 
 
328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  31.1 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
328 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  26.26 
 
 
843 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  30.06 
 
 
328 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
339 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
329 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
383 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  31.4 
 
 
328 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
328 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
358 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  27.65 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
351 aa  89  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  24.56 
 
 
329 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  24.85 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  31.72 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  24.44 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  24.79 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  23.03 
 
 
323 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  22.69 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  22.97 
 
 
355 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  29.02 
 
 
349 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  22.28 
 
 
389 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  27.38 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  32.91 
 
 
316 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  25.2 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
338 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  41.27 
 
 
348 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  34.62 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  37.7 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  29.32 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  32.1 
 
 
465 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  38.1 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  32.58 
 
 
370 aa  46.6  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  41.3 
 
 
366 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  41.3 
 
 
484 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  48.89 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  46.3 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  43.48 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0851  UDP-galactopyranose mutase  51.28 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  42.59 
 
 
436 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  43.24 
 
 
501 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  45.28 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.33 
 
 
474 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3794  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 
411 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  28.32 
 
 
491 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  35.09 
 
 
508 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4345  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  31.03 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  34.25 
 
 
505 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  43.4 
 
 
436 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.33 
 
 
472 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  43.4 
 
 
436 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  34.29 
 
 
490 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  43.4 
 
 
436 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  31.58 
 
 
499 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09250  flavin-dependent dehydrogenase  45 
 
 
442 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.696714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  32.86 
 
 
490 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  32.86 
 
 
482 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  43.4 
 
 
436 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  32.86 
 
 
482 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  43.4 
 
 
436 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  43.4 
 
 
436 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  35.62 
 
 
479 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  41.3 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  32.86 
 
 
485 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  32.86 
 
 
482 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.14 
 
 
459 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  32.86 
 
 
490 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  32.86 
 
 
487 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  39.13 
 
 
245 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  46.81 
 
 
507 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 
533 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  33.33 
 
 
381 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  41.3 
 
 
923 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  34.18 
 
 
421 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>