More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0116 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  100 
 
 
491 aa  997    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  48.47 
 
 
498 aa  478  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  46.73 
 
 
527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  47.26 
 
 
499 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  47.25 
 
 
490 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  44.16 
 
 
490 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  45.66 
 
 
500 aa  431  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  42.88 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  42.59 
 
 
506 aa  404  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  40.96 
 
 
501 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  39.71 
 
 
497 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  39.43 
 
 
488 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  39.71 
 
 
488 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  38.07 
 
 
493 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  40.33 
 
 
526 aa  361  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  37.45 
 
 
552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  36.81 
 
 
532 aa  310  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  36.89 
 
 
536 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  37.23 
 
 
548 aa  301  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  35.08 
 
 
542 aa  300  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  40.37 
 
 
460 aa  289  8e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  36.36 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  34.82 
 
 
497 aa  272  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  35.23 
 
 
453 aa  271  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  35.15 
 
 
566 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  37.23 
 
 
551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  31.01 
 
 
502 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  31.01 
 
 
502 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  35.52 
 
 
550 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  33.6 
 
 
505 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  36.21 
 
 
492 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  30.32 
 
 
494 aa  253  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  30.35 
 
 
492 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  31.68 
 
 
511 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  31.4 
 
 
511 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  31.97 
 
 
508 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  31.47 
 
 
511 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  30.75 
 
 
509 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  30.32 
 
 
512 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  30.46 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  31.85 
 
 
507 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  30.32 
 
 
512 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  30.06 
 
 
553 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  30.28 
 
 
511 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  31.69 
 
 
512 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  27.72 
 
 
537 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  30.27 
 
 
504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.71 
 
 
508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  30.55 
 
 
504 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  32.12 
 
 
491 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  31.33 
 
 
525 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  30.14 
 
 
493 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  29.96 
 
 
509 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  28.78 
 
 
531 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  29.53 
 
 
519 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  29.92 
 
 
504 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  31.14 
 
 
489 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  30.06 
 
 
508 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  31.51 
 
 
502 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  31.85 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  28.95 
 
 
518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  30.39 
 
 
498 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.74 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  25.49 
 
 
499 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  30.18 
 
 
519 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  31.58 
 
 
492 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  30.18 
 
 
503 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  30.12 
 
 
508 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  30.69 
 
 
506 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  29.01 
 
 
521 aa  193  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  27.73 
 
 
492 aa  192  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  31.42 
 
 
494 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  29.96 
 
 
495 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  32.17 
 
 
495 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  29.92 
 
 
508 aa  190  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  30.26 
 
 
530 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  30.14 
 
 
530 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  27.47 
 
 
492 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  29.51 
 
 
495 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.79 
 
 
546 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  27.54 
 
 
529 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  27.8 
 
 
552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  30.47 
 
 
475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  28.25 
 
 
553 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  28.6 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  28.88 
 
 
503 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  29.68 
 
 
504 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  27.77 
 
 
492 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  30.57 
 
 
507 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  30.69 
 
 
506 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  27.77 
 
 
492 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.89 
 
 
518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  29.5 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  29.5 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  29.5 
 
 
512 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  30.1 
 
 
492 aa  173  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.52 
 
 
549 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  25.91 
 
 
497 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  25.91 
 
 
497 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  29.64 
 
 
494 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>