More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2903 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 358 aa  728    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  76.75 
 
 		 383 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  63.66 
 
 		 351 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  62.67 
 
 		 368 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  62.57 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  60.39 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  60.11 
 
 		 367 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  61.52 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  52.76 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  39.26 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  39.38 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  37.96 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  40.29 
 
 		 330 aa  189  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  37.18 
 
 		 355 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  36.65 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  37.36 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  36.29 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  34.48 
 
 		 843 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  36.29 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 		 313 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  35.91 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  34.52 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  35.01 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 339 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  35.1 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  31.23 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  28.42 
 
 		 359 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.54 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  32.17 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 346 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 413 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  30.91 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  24.93 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  30.35 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  26.95 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  29.02 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  28.74 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  27.14 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.54 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  26.65 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  28.17 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  25.67 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  27.02 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  40.98 
 
 		 491 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_92705  predicted protein  22.28 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  47.62 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  46 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  46 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  50 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  46.03 
 
 		 670 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1168  amine oxidase  36.7 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1169  amine oxidase  43.84 
 
 		 416 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  27.93 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1239  amine oxidase  43.84 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  39.51 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  39.51 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  39.51 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  39.51 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  48.89 
 
 		 493 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  34.02 
 
 		 435 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  35.9 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  34.07 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  44.9 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  42.47 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  42.86 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  42.86 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000290195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  44.9 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  44.9 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  41.67 
 
 		 645 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  43.4 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 1481 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  41.67 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  41.51 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  32.77 
 
 		 645 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  30.47 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  45.83 
 
 		 628 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.89 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2711  amine oxidase  41.1 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  38.36 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>