More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39472 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  100 
 
 
645 aa  1323    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  51.57 
 
 
530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  46.52 
 
 
515 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  44.4 
 
 
512 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  44.08 
 
 
512 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 
512 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  43.95 
 
 
554 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  38.7 
 
 
595 aa  341  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  38.55 
 
 
509 aa  336  9e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  38.36 
 
 
509 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
502 aa  330  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  34.35 
 
 
509 aa  323  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  35.43 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  33.78 
 
 
509 aa  317  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  33.78 
 
 
509 aa  317  5e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  38.4 
 
 
516 aa  316  9e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  38.31 
 
 
598 aa  313  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
506 aa  313  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  38.45 
 
 
497 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  38.99 
 
 
511 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  39.03 
 
 
513 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  38.68 
 
 
510 aa  303  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.53 
 
 
633 aa  300  7e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  37.48 
 
 
504 aa  279  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  35.27 
 
 
635 aa  276  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  33.15 
 
 
522 aa  226  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  32.54 
 
 
508 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  30.53 
 
 
503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  30.52 
 
 
503 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  31.79 
 
 
505 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
503 aa  204  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  31.97 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  31.97 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  30.93 
 
 
507 aa  194  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
506 aa  193  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  30.87 
 
 
506 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  31.38 
 
 
520 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  31.19 
 
 
520 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  31.96 
 
 
518 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  31.13 
 
 
516 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  31.52 
 
 
504 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  30.97 
 
 
518 aa  182  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  29.62 
 
 
514 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  29.75 
 
 
514 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  30 
 
 
520 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  30.68 
 
 
514 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 
532 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  28.81 
 
 
508 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  29.39 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  26.68 
 
 
938 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
501 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  27.95 
 
 
517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  25.55 
 
 
499 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.88 
 
 
505 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
717 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 
722 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  31.39 
 
 
711 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  29.49 
 
 
708 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  23.7 
 
 
499 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
547 aa  100  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.65 
 
 
564 aa  97.8  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  24.01 
 
 
510 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  23.52 
 
 
499 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
547 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  25.74 
 
 
504 aa  96.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  27.32 
 
 
523 aa  95.5  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.34 
 
 
492 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 
565 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
554 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  24.08 
 
 
489 aa  90.1  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
554 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  26.66 
 
 
547 aa  89.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.32 
 
 
493 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.74 
 
 
740 aa  86.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 
559 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  24.14 
 
 
512 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  23.91 
 
 
527 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 
563 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.08 
 
 
511 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  24.19 
 
 
533 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  22.93 
 
 
923 aa  79.7  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  25.86 
 
 
506 aa  77.8  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  24.41 
 
 
519 aa  77.4  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.2 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  24.51 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  24.39 
 
 
475 aa  77.4  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
518 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  24.82 
 
 
512 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  22.94 
 
 
531 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 
547 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  23.33 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  22.72 
 
 
555 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 
520 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 
520 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  21.63 
 
 
586 aa  74.7  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>