More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12221 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  70.28 
 
 
520 aa  762    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  59.2 
 
 
506 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  65.94 
 
 
516 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  63.37 
 
 
518 aa  739    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  62.28 
 
 
506 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  65.11 
 
 
518 aa  744    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  92.8 
 
 
514 aa  968    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  60.56 
 
 
504 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  100 
 
 
514 aa  1048    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  58.02 
 
 
508 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  61.35 
 
 
532 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  61.9 
 
 
512 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  96.69 
 
 
514 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  61.9 
 
 
512 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  84.63 
 
 
514 aa  898    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  71.01 
 
 
520 aa  764    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  66.4 
 
 
520 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  43.56 
 
 
503 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  42.49 
 
 
522 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  43.34 
 
 
508 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  41.27 
 
 
507 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  41.78 
 
 
505 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  41.9 
 
 
503 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  41.27 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 
502 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  32.38 
 
 
513 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
515 aa  266  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
506 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
497 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
497 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
512 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
512 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  28.04 
 
 
938 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  32.42 
 
 
509 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  32.62 
 
 
509 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  33.27 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  31.43 
 
 
512 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  28.4 
 
 
554 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  32.49 
 
 
509 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  33.33 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  32.09 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  29.75 
 
 
595 aa  213  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  28.79 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  29.45 
 
 
511 aa  200  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  30.19 
 
 
645 aa  193  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  28.43 
 
 
504 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  29.9 
 
 
510 aa  190  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  29.57 
 
 
516 aa  186  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  27.24 
 
 
633 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  29.18 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 
501 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  26.85 
 
 
499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.44 
 
 
740 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  26.55 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  25.47 
 
 
504 aa  148  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  26.31 
 
 
499 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  25.2 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  27.19 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  26.31 
 
 
499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  25.47 
 
 
517 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  30.79 
 
 
635 aa  140  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.79 
 
 
489 aa  139  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  25.3 
 
 
523 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  28.22 
 
 
495 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  29.46 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
547 aa  134  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.48 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  27.69 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  26.81 
 
 
502 aa  128  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.39 
 
 
492 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  26.08 
 
 
711 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 
500 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.29 
 
 
511 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.74 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.54 
 
 
512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 
717 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.37 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.88 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  27.31 
 
 
507 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  24.81 
 
 
503 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  25.99 
 
 
549 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  22.8 
 
 
530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.17 
 
 
542 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.21 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.68 
 
 
518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  23.67 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.74 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  26.13 
 
 
546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  21.58 
 
 
504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.97 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  24.9 
 
 
708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  23.37 
 
 
493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.34 
 
 
519 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  25.79 
 
 
501 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  21.18 
 
 
496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  22.12 
 
 
503 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 
722 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
556 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>