More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1888 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  79.13 
 
 		 508 aa  837    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  71.23 
 
 		 522 aa  770    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  66.67 
 
 		 507 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  100 
 
 		 505 aa  1040    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  65.53 
 
 		 503 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  67.74 
 
 		 503 aa  728    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  67.86 
 
 		 503 aa  731    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  45.72 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  44.1 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  44.89 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  43.65 
 
 		 506 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  44.89 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  46.26 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  41.63 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  42.75 
 
 		 520 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  41.67 
 
 		 520 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  43.37 
 
 		 516 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  44.14 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  41.9 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  41.09 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  41.5 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  41.5 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 502 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  33.61 
 
 		 513 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 497 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 497 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 515 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 512 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  30.91 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  29.38 
 
 		 938 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  31.54 
 
 		 511 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  31.6 
 
 		 554 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  31.37 
 
 		 645 aa  204  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  30.92 
 
 		 516 aa  192  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  30.6 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  26.02 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  29.33 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  25 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  29.56 
 
 		 598 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  28.44 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  25.94 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  25.59 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  28 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  28.16 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  30.86 
 
 		 489 aa  170  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  27.92 
 
 		 633 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  26.38 
 
 		 595 aa  156  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  29.96 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  29.49 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  30.12 
 
 		 508 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 717 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.35 
 
 		 523 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  27.05 
 
 		 499 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.59 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  25.98 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.86 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  25.98 
 
 		 499 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  26.55 
 
 		 504 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  27.73 
 
 		 531 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  29.98 
 
 		 508 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.53 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.17 
 
 		 493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.74 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.66 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  28.52 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.26 
 
 		 505 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  27.03 
 
 		 635 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  28.54 
 
 		 708 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 722 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.06 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  24.8 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.94 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  29.51 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  26.71 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  25.75 
 
 		 553 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.66 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27.94 
 
 		 711 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  25.77 
 
 		 552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  25.92 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  29.26 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  26.72 
 
 		 507 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  27.65 
 
 		 504 aa  116  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  26.13 
 
 		 546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.57 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  25.67 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  26.12 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.26 
 
 		 505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.6 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  24.17 
 
 		 586 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  25.2 
 
 		 512 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  26.52 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.26 
 
 		 522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>