More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1486 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  76.89 
 
 
554 aa  840    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  94.55 
 
 
559 aa  1083    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
554 aa  1138    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  65.26 
 
 
547 aa  742    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  41.86 
 
 
556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 
514 aa  431  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.83 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  43.54 
 
 
545 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  41.98 
 
 
510 aa  369  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
547 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 
551 aa  349  8e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 
564 aa  333  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  40.75 
 
 
526 aa  322  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
516 aa  316  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 
537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
518 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  38.4 
 
 
533 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  39.66 
 
 
532 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  39.48 
 
 
532 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
549 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 
536 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  37.45 
 
 
527 aa  283  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 
547 aa  281  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 
532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
537 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
535 aa  267  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
539 aa  267  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 
536 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
533 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
536 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 
535 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  34.28 
 
 
530 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  35.51 
 
 
531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
531 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 
531 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  35.87 
 
 
530 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 
552 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 
524 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.74 
 
 
527 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
528 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  33.15 
 
 
529 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
523 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
534 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
536 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
545 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
532 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.6 
 
 
545 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
531 aa  188  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
533 aa  178  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
530 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
530 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
530 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
521 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
523 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
520 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
526 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
522 aa  163  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
517 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
524 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
528 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
519 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
520 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.55 
 
 
548 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 
520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
528 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.16 
 
 
536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
531 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
560 aa  146  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
481 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  29.33 
 
 
535 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  25.95 
 
 
476 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
523 aa  141  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
474 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
531 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
528 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  30.06 
 
 
530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.01 
 
 
470 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
478 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
484 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.08 
 
 
472 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  25 
 
 
476 aa  120  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.92 
 
 
505 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.4 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  26.17 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>