More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0735 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  73.31 
 
 
565 aa  879    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
563 aa  1167    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  71.51 
 
 
547 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  72.42 
 
 
564 aa  872    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  70.18 
 
 
561 aa  820    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  64.93 
 
 
556 aa  770    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 
554 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
554 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
547 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 
559 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  35.47 
 
 
556 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
510 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
545 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
555 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
514 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.72 
 
 
510 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
536 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  33.33 
 
 
532 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  29.84 
 
 
533 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  33.33 
 
 
532 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
537 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
547 aa  227  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
532 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  31.8 
 
 
510 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
516 aa  222  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  30.61 
 
 
530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  32.1 
 
 
530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
530 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.27 
 
 
527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
537 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
539 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.21 
 
 
526 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
535 aa  206  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
528 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.49 
 
 
545 aa  204  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.86 
 
 
527 aa  203  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
531 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  30.78 
 
 
531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  29.54 
 
 
529 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
531 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
551 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
536 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
552 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
536 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
531 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.96 
 
 
548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
532 aa  183  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
523 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
523 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
530 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
534 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
528 aa  173  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
533 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
531 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
522 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
517 aa  170  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.89 
 
 
545 aa  167  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
531 aa  165  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
534 aa  163  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
560 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
534 aa  156  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
528 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 
523 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
580 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
474 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.64 
 
 
535 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
519 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  23.72 
 
 
476 aa  127  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  26.08 
 
 
465 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
520 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
520 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  25.66 
 
 
536 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
520 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.05 
 
 
492 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.72 
 
 
506 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.28 
 
 
493 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.46 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  23.52 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.7 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.32 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.14 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  23.46 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  26.77 
 
 
505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25 
 
 
511 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>