More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0871 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  68.11 
 
 		 512 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  100 
 
 		 512 aa  1049    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  70.59 
 
 		 512 aa  764    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  73.33 
 
 		 515 aa  802    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  53.28 
 
 		 554 aa  550  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  46.68 
 
 		 509 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  46.68 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  49.71 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  48.33 
 
 		 598 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  50.31 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  50.71 
 
 		 510 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  46.97 
 
 		 595 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  41.78 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  41.39 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  42.77 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  46.39 
 
 		 502 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  41.01 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  45.05 
 
 		 645 aa  430  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  47.91 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  47.59 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 		 497 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  46.98 
 
 		 513 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  42.38 
 
 		 633 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  40.49 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  39.68 
 
 		 504 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  40 
 
 		 635 aa  309  8e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  36.15 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  35.86 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  35.95 
 
 		 512 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 532 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  35.29 
 
 		 508 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  33.99 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  34.89 
 
 		 507 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 503 aa  249  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  32.6 
 
 		 508 aa  247  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  33.92 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  33.59 
 
 		 520 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  31.3 
 
 		 522 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  33.78 
 
 		 518 aa  239  6.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  31.09 
 
 		 505 aa  237  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  31.53 
 
 		 520 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  34.18 
 
 		 504 aa  236  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  33.21 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  31.4 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  30.56 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  31.03 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  31.03 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  31.24 
 
 		 514 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  30.63 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  27.36 
 
 		 938 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.51 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  27.92 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.38 
 
 		 493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  27.71 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 564 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 717 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  28.6 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  28.95 
 
 		 711 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.69 
 
 		 499 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  25.25 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 547 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  27.22 
 
 		 505 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.9 
 
 		 523 aa  114  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 722 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  29.78 
 
 		 708 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 484 aa  113  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.32 
 
 		 522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.34 
 
 		 740 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25.84 
 
 		 518 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 561 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.17 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  25.44 
 
 		 504 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 510 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.58 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.05 
 
 		 507 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  27.27 
 
 		 510 aa  104  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 520 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  25.43 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.79 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 559 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 554 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 534 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  28.4 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.52 
 
 		 504 aa  98.2  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.44 
 
 		 508 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  24.53 
 
 		 512 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.25 
 
 		 531 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  25.32 
 
 		 512 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 500 aa  97.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>