272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1385 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 492 aa  966    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  69.75 
 
 		 500 aa  581  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  37.6 
 
 		 489 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  35.91 
 
 		 494 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  36.1 
 
 		 491 aa  216  8e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  34.6 
 
 		 495 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  34.96 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  31.5 
 
 		 504 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  31.91 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  31.52 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  31.1 
 
 		 505 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  31.72 
 
 		 499 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  30.08 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  29.07 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  29.17 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  29.32 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  32.56 
 
 		 523 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  32.36 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  26.49 
 
 		 501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  28.76 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  30.58 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  27.45 
 
 		 503 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  26.14 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  26.87 
 
 		 522 aa  144  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  26.79 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  27.29 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  26.95 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  28.46 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  28.46 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 503 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 532 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  30.99 
 
 		 495 aa  136  9e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  26.43 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  28.18 
 
 		 504 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 530 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  25.73 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  26.73 
 
 		 520 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  25.73 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  26.47 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  27.08 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  25.73 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  26.94 
 
 		 518 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.24 
 
 		 514 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  24.86 
 
 		 503 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  29.35 
 
 		 507 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.67 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  24.11 
 
 		 514 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  25.59 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  24.22 
 
 		 514 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 515 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  23.57 
 
 		 938 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.7 
 
 		 513 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  24.12 
 
 		 509 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  27.6 
 
 		 511 aa  96.7  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  24.21 
 
 		 509 aa  96.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  26.48 
 
 		 554 aa  95.9  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  26.17 
 
 		 512 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  23.14 
 
 		 509 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  26.31 
 
 		 598 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  23.52 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  24.57 
 
 		 645 aa  94  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  25.24 
 
 		 595 aa  93.6  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 512 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  25.09 
 
 		 530 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  28.24 
 
 		 516 aa  87.8  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  27.36 
 
 		 510 aa  86.7  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 717 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  23.67 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.87 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  24.42 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  24.42 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  24.95 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  27.62 
 
 		 708 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  20.45 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  21.61 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.83 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.83 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  29.51 
 
 		 519 aa  72  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 722 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  33 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  19.54 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  29.11 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  31.23 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  31.65 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.42 
 
 		 511 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.47 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.89 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.49 
 
 		 519 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  25.67 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  21.79 
 
 		 740 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.12 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  24.63 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>