182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3446 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  993    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  26.43 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  27.14 
 
 		 499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  25.65 
 
 		 523 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  26.35 
 
 		 499 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  26.18 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  26.35 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.85 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  26.1 
 
 		 504 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  27.67 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.6 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  23.71 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  26.51 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  26.52 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  26.09 
 
 		 500 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.28 
 
 		 495 aa  143  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  25.15 
 
 		 501 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  26.04 
 
 		 501 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  25.45 
 
 		 501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  25 
 
 		 491 aa  136  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  26.83 
 
 		 512 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  26.68 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  24.8 
 
 		 508 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  26.72 
 
 		 506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  24.24 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  20.69 
 
 		 530 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  25.6 
 
 		 518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  24.8 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  24.9 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  23.83 
 
 		 495 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  25.1 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  25.2 
 
 		 504 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  26.74 
 
 		 492 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.46 
 
 		 503 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  24.4 
 
 		 518 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.69 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.34 
 
 		 505 aa  97.8  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  22.75 
 
 		 938 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  22.91 
 
 		 508 aa  93.6  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.38 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  26.07 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  23.53 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.48 
 
 		 503 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  22.65 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  22.98 
 
 		 474 aa  90.1  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  26 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  26.27 
 
 		 514 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  25.57 
 
 		 514 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.24 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  24.19 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  22.97 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  32.64 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.2 
 
 		 513 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  21.03 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  22.47 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  27.44 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  21.4 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  23.03 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  23.03 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.43 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.68 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 506 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  21.8 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  22.48 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  21.32 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.36 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  20.47 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  25.58 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  21.39 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.66 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.42 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  26.88 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  22.79 
 
 		 546 aa  57  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  24.19 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  19.78 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  20.54 
 
 		 508 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 		 512 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  18.98 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  20.27 
 
 		 498 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  38.37 
 
 		 531 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  35.42 
 
 		 504 aa  54.3  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  22.2 
 
 		 497 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  22.2 
 
 		 497 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  20.66 
 
 		 635 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  21.8 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  36.71 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  37.93 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>