More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3278 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  66.73 
 
 		 497 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  69.62 
 
 		 513 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  68.3 
 
 		 506 aa  683    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 502 aa  1021    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  66.73 
 
 		 497 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  49.6 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  46.71 
 
 		 512 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  46.39 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  45.98 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  40.43 
 
 		 595 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  40.44 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  42.77 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  38.15 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  38.15 
 
 		 509 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  41.84 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  35.84 
 
 		 509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  39.62 
 
 		 645 aa  313  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  38.76 
 
 		 598 aa  313  5.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  35.01 
 
 		 509 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  39.55 
 
 		 510 aa  312  1e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  35.09 
 
 		 509 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  38.03 
 
 		 512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  38.03 
 
 		 512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  36.03 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  36.22 
 
 		 509 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 506 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  37.17 
 
 		 504 aa  286  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  34.86 
 
 		 520 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  37.4 
 
 		 508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  34.66 
 
 		 520 aa  283  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 532 aa  283  6.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  37.59 
 
 		 530 aa  283  7.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  33.99 
 
 		 520 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.55 
 
 		 633 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 503 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  34.39 
 
 		 503 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  36.65 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  35.2 
 
 		 518 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  35.1 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  33.91 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  33.99 
 
 		 516 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  33.6 
 
 		 522 aa  263  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  34.2 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  34.53 
 
 		 505 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  32.47 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  32.46 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  32.93 
 
 		 514 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  31.84 
 
 		 514 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  34.57 
 
 		 635 aa  206  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  28.14 
 
 		 938 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  27.5 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  28.14 
 
 		 518 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.61 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 717 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  27.96 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  27.96 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.19 
 
 		 740 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  26.44 
 
 		 504 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  27.78 
 
 		 708 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  24.85 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.42 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.1 
 
 		 511 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.15 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  26.56 
 
 		 546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.85 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  27.66 
 
 		 523 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 722 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.85 
 
 		 531 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.73 
 
 		 498 aa  113  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  27.63 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.04 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.1 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  25.41 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  26.2 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.21 
 
 		 489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  26.61 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  25.7 
 
 		 711 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  25.1 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  26.82 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  27.04 
 
 		 506 aa  107  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.61 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  24.44 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 547 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.47 
 
 		 559 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.39 
 
 		 508 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 492 aa  103  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.4 
 
 		 511 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  26.01 
 
 		 505 aa  101  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  23.73 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  26.85 
 
 		 556 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>