More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0626 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  100 
 
 		 507 aa  1019    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  66.67 
 
 		 505 aa  704    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  65.19 
 
 		 503 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  67.6 
 
 		 508 aa  716    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  67.14 
 
 		 522 aa  716    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  65 
 
 		 503 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  67.6 
 
 		 503 aa  724    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  46.29 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  46.29 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  44.44 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  44.06 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  44.12 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  45.05 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  44.66 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  42.13 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  43.33 
 
 		 518 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  43.75 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  41.93 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  42.13 
 
 		 516 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  41.11 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  41.3 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  40.45 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  39.72 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  36.4 
 
 		 513 aa  272  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 		 502 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 506 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 515 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 497 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 497 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 512 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  31.64 
 
 		 938 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  33.47 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  32.27 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  34.46 
 
 		 511 aa  206  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  30.16 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  29.65 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  30.94 
 
 		 554 aa  196  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  30.67 
 
 		 645 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  30.65 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  26.17 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  32.73 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  32.14 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  26.33 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  25.93 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  28.05 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  28.49 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  31.14 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  30.69 
 
 		 530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  30.53 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 717 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  30.16 
 
 		 499 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  28.63 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  28.05 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  27.56 
 
 		 633 aa  146  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  31.09 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 722 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  32.25 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  28.08 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  28.24 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.38 
 
 		 504 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.73 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  29.32 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  32.25 
 
 		 711 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  33.4 
 
 		 708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  27.13 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  28.26 
 
 		 510 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.6 
 
 		 511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.55 
 
 		 546 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  29.11 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.68 
 
 		 511 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  28.07 
 
 		 491 aa  126  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  27.6 
 
 		 492 aa  124  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  29.02 
 
 		 635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.57 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  26.63 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  26.81 
 
 		 553 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  24.61 
 
 		 484 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  26.68 
 
 		 517 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  28.38 
 
 		 512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  31.3 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  29.26 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  28.33 
 
 		 556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  27 
 
 		 522 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.34 
 
 		 511 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  31.09 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  26.42 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.34 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  26.5 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  29.61 
 
 		 508 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.53 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 520 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  27.01 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.15 
 
 		 492 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  29.54 
 
 		 501 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>