299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0319 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  100 
 
 
489 aa  986    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  60.33 
 
 
494 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  54.03 
 
 
491 aa  475  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  53.28 
 
 
495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  52.4 
 
 
492 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  37.07 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  34.88 
 
 
505 aa  227  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  33.79 
 
 
504 aa  226  7e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 
492 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  34.62 
 
 
499 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  34.96 
 
 
499 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  34.27 
 
 
510 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  37.63 
 
 
523 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  30.53 
 
 
517 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  33.13 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  30.69 
 
 
501 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  31.14 
 
 
507 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  28.66 
 
 
501 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  30.99 
 
 
505 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  30.86 
 
 
505 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  29.63 
 
 
503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  30.41 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  29.62 
 
 
522 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  28.72 
 
 
501 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  30.62 
 
 
508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  29.38 
 
 
503 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  28.4 
 
 
504 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  27.9 
 
 
501 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  26.2 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
532 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
530 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  28.14 
 
 
508 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  29.43 
 
 
503 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  32.79 
 
 
500 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  25.77 
 
 
512 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  25.56 
 
 
512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  25.6 
 
 
474 aa  139  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
515 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  29.58 
 
 
503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
506 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  26.25 
 
 
520 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  24.95 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  26.15 
 
 
520 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  26.61 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  25.6 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  25.6 
 
 
514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  25.25 
 
 
514 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  31.2 
 
 
495 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  24.3 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
512 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  27.35 
 
 
518 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  23.94 
 
 
514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  26.32 
 
 
518 aa  120  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  27.18 
 
 
938 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  25.26 
 
 
512 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
512 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25.78 
 
 
537 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  27.38 
 
 
511 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  26.43 
 
 
633 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  27.27 
 
 
508 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.19 
 
 
509 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  22.27 
 
 
509 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.13 
 
 
507 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  25.21 
 
 
497 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  24.76 
 
 
509 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.08 
 
 
509 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.87 
 
 
511 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
497 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.93 
 
 
508 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.05 
 
 
513 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.05 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.15 
 
 
511 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  22.92 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  22.1 
 
 
509 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.35 
 
 
505 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  21.89 
 
 
509 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  25.82 
 
 
510 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.95 
 
 
511 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  22.22 
 
 
494 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  23.98 
 
 
554 aa  90.9  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03825  hypothetical protein  21.21 
 
 
508 aa  90.9  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
534 aa  90.5  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  27.51 
 
 
708 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  26.55 
 
 
504 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  24.08 
 
 
645 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.95 
 
 
511 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  27.36 
 
 
509 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  27.08 
 
 
508 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  24.42 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  23.55 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  26.03 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  24.06 
 
 
518 aa  84  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  26.97 
 
 
508 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  26.2 
 
 
519 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  27.82 
 
 
595 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.05 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>