More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3112 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  59.8 
 
 		 520 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 506 aa  1054    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  74.11 
 
 		 506 aa  808    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  61.98 
 
 		 518 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  62.99 
 
 		 516 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  61.18 
 
 		 518 aa  670    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  59.21 
 
 		 514 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  73.32 
 
 		 504 aa  767    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  68.62 
 
 		 508 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  75.83 
 
 		 512 aa  819    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  59.2 
 
 		 514 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  74.21 
 
 		 532 aa  811    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  76.03 
 
 		 512 aa  820    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  59.6 
 
 		 514 aa  643    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  59.8 
 
 		 514 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  59.45 
 
 		 520 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  62.6 
 
 		 520 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  45.07 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  43.14 
 
 		 507 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  44.29 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  42.86 
 
 		 522 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  43.86 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  41.25 
 
 		 503 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 502 aa  289  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  34.23 
 
 		 513 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 515 aa  264  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 497 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 512 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  33.47 
 
 		 554 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  29.08 
 
 		 938 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  33.47 
 
 		 509 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  33.27 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  31.49 
 
 		 504 aa  210  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  31.76 
 
 		 509 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  32.3 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  30.91 
 
 		 509 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  37.42 
 
 		 512 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  30.02 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  31.14 
 
 		 595 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  31.29 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  33.4 
 
 		 516 aa  192  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  31.07 
 
 		 645 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  31.59 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  28.84 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 501 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  28.97 
 
 		 633 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  29.72 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  29.47 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  29.77 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  28.18 
 
 		 504 aa  151  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  29.88 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  28.34 
 
 		 494 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.36 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  28.36 
 
 		 491 aa  137  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.43 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.7 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 717 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.84 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.71 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.43 
 
 		 708 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.13 
 
 		 505 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.74 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.01 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  26.85 
 
 		 502 aa  128  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.51 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 722 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.44 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  25.14 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.81 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.8 
 
 		 511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.84 
 
 		 511 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.09 
 
 		 504 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.94 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  26.73 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  26.43 
 
 		 635 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  25.48 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.95 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 492 aa  118  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.95 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  26.22 
 
 		 495 aa  117  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  25.1 
 
 		 711 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  24.82 
 
 		 549 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  25.77 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.74 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.26 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  24.76 
 
 		 504 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 496 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 554 aa  110  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.2 
 
 		 508 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  24.75 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  25.69 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  26.16 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>