More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0760 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  70.78 
 
 		 522 aa  759    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  67.6 
 
 		 507 aa  724    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  67.74 
 
 		 505 aa  717    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  74.16 
 
 		 503 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  70 
 
 		 508 aa  746    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 503 aa  1032    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  68.59 
 
 		 503 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  44.89 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  44.89 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  44.89 
 
 		 512 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  44.56 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  42.11 
 
 		 518 aa  411  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  42.75 
 
 		 518 aa  411  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  42.08 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  41.93 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  41.19 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  42.32 
 
 		 516 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  40.89 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  41.19 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  41.01 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  40.69 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  41.13 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  34.57 
 
 		 513 aa  266  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 497 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 515 aa  247  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  30.83 
 
 		 938 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 512 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 512 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  30.77 
 
 		 512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  31.61 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  30.22 
 
 		 509 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  29.54 
 
 		 509 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  30.06 
 
 		 504 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  29.48 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  30.83 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  28.86 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  30.36 
 
 		 645 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  28.91 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  28.54 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  29.83 
 
 		 598 aa  187  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  31.18 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  29.86 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  27.31 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  28.17 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  31.31 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 501 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  28.63 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  28.21 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.38 
 
 		 499 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  27.21 
 
 		 633 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.57 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  29.89 
 
 		 523 aa  152  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.19 
 
 		 518 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  26.82 
 
 		 499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  28.26 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.88 
 
 		 511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  28.18 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  27.17 
 
 		 549 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  26.45 
 
 		 510 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.68 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  26.99 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 717 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  28.4 
 
 		 508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.19 
 
 		 511 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.87 
 
 		 511 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  27.94 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.9 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 		 484 aa  126  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  31.64 
 
 		 635 aa  124  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 511 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  26.93 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 500 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  27.08 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  27.08 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  24.81 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  28.09 
 
 		 508 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  28.09 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  26.37 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.97 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  29.27 
 
 		 708 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.31 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  25.98 
 
 		 553 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  27.7 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  27.64 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  25.53 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.39 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  26.13 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  26.24 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  23.16 
 
 		 586 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  24.15 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>