214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2352 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 495 aa  1016    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  24.68 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 503 aa  113  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  24.33 
 
 		 512 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.14 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  22.41 
 
 		 506 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  23.68 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  23.98 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  22.92 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  25.14 
 
 		 518 aa  100  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 506 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  23.01 
 
 		 518 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  24.43 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.71 
 
 		 532 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 		 559 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  22.73 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.54 
 
 		 508 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  24.19 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  21.51 
 
 		 514 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  23.49 
 
 		 717 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  20.79 
 
 		 516 aa  86.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  25.76 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  21.51 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  20.27 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 554 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  23.51 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  24.07 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  24.12 
 
 		 531 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  23.31 
 
 		 938 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  21.25 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  20.9 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  22.4 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  20.93 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  20.4 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  20.77 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  24.57 
 
 		 503 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  24.56 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  22.47 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  25.23 
 
 		 711 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  21.94 
 
 		 555 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  22.22 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  23.75 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  22.77 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.46 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.66 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  21.47 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  22.78 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.26 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 537 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 524 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 488 aa  67  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  19.21 
 
 		 509 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3171  phytoene dehydrogenase, putative  24.46 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  20.39 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  20.16 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  23.87 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  23.87 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  21.05 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.3 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  20.04 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  18.59 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  20.46 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  22.29 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  24.91 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  24.91 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  20.15 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  20.99 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1301  amine oxidase  20.77 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  20.45 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  23.23 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  23.75 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  20.79 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  22.07 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  23.65 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  19.44 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  23.09 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  22.11 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  21.59 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  22.74 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  20.53 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  20.88 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  30.63 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  24.84 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>