286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0346 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  100 
 
 		 494 aa  1006    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  60.95 
 
 		 489 aa  597  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0245  amine oxidase  53.7 
 
 		 491 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  53.33 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  53.35 
 
 		 492 aa  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 501 aa  259  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  35.79 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  35.52 
 
 		 499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  36.77 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  34.65 
 
 		 504 aa  222  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1385  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0115639 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  35.59 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  32.88 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17531  phytoene dehydrogenase  29.49 
 
 		 501 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  31.01 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  32.47 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  28.97 
 
 		 501 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  29.52 
 
 		 501 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  30.89 
 
 		 522 aa  163  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17571  phytoene dehydrogenase and related protein  29.12 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  30.59 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  30.06 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  31.12 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  29.13 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16851  phytoene dehydrogenase and related protein  30.34 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  30.39 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3446  phytoene dehydrogenase  26.35 
 
 		 489 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  29.88 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  28.71 
 
 		 503 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 		 503 aa  150  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 506 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22931  phytoene dehydrogenase  29.19 
 
 		 503 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  26.25 
 
 		 512 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  26.05 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  28.35 
 
 		 504 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  30.53 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 532 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  25.51 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  26.81 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  27.46 
 
 		 508 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1944  phytoene dehydrogenase related enzyme  30.2 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  26.37 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  25.83 
 
 		 516 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  23.54 
 
 		 474 aa  126  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  25.7 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  27.27 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  26.52 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  26.37 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 515 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.74 
 
 		 938 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 506 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.86 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.75 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  24.27 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  25.81 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 512 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  26.05 
 
 		 645 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  23.05 
 
 		 509 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  25.54 
 
 		 518 aa  103  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  24.15 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.15 
 
 		 740 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  26.06 
 
 		 513 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  22.8 
 
 		 509 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25 
 
 		 537 aa  96.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.43 
 
 		 501 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  23.08 
 
 		 595 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  26.11 
 
 		 510 aa  93.2  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  22.5 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  23.31 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  23.95 
 
 		 492 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  25 
 
 		 509 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  26.97 
 
 		 507 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.48 
 
 		 553 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  25.24 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  22.82 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  22.97 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.61 
 
 		 511 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  27.73 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  25.44 
 
 		 508 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.61 
 
 		 511 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  23.41 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  22.68 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  22.68 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  22.87 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  24.56 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.86 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  24.21 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  22.87 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  22.14 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  20.78 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  22.24 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  22.03 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  24.41 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>