More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45243 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  100 
 
 		 598 aa  1239    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  47.81 
 
 		 512 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  45.78 
 
 		 512 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  41.97 
 
 		 554 aa  392  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  38.54 
 
 		 509 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  38.49 
 
 		 595 aa  358  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  37.55 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  34.52 
 
 		 509 aa  349  9e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  38.87 
 
 		 511 aa  344  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  33.96 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  33.96 
 
 		 509 aa  340  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  35.63 
 
 		 509 aa  337  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  40.27 
 
 		 516 aa  333  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 		 502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  37.18 
 
 		 510 aa  324  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  36.3 
 
 		 633 aa  316  8e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  38.31 
 
 		 645 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 506 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  38.85 
 
 		 513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  37.11 
 
 		 497 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  36.94 
 
 		 530 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  37.48 
 
 		 635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  34.4 
 
 		 504 aa  267  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  30.92 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  30.81 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 532 aa  203  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  28.79 
 
 		 514 aa  196  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  29.42 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  29.5 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  28.25 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  28.44 
 
 		 514 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  28.52 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  28.02 
 
 		 520 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  30.21 
 
 		 518 aa  194  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  29.4 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  29.43 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  28.87 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  29.47 
 
 		 508 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  29.25 
 
 		 512 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 506 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  30.74 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  29.66 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  29.81 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  29.5 
 
 		 505 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  28.84 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  28.86 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  26.65 
 
 		 938 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 547 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 555 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 565 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.66 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.32 
 
 		 740 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 564 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 717 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 563 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  28.68 
 
 		 711 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.63 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  25.74 
 
 		 506 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 534 aa  100  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 528 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.54 
 
 		 493 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 722 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  25.24 
 
 		 509 aa  97.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 484 aa  97.1  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 554 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  24.77 
 
 		 529 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.6 
 
 		 531 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.05 
 
 		 512 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 510 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.77 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.4 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  24.91 
 
 		 511 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 		 554 aa  90.5  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.31 
 
 		 530 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.09 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  25.32 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  23.39 
 
 		 505 aa  89  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.69 
 
 		 511 aa  88.2  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  24.45 
 
 		 518 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 524 aa  87.8  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.52 
 
 		 708 aa  87.8  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  24.45 
 
 		 518 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 537 aa  87  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.1 
 
 		 527 aa  87  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  25.27 
 
 		 491 aa  86.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 559 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  24.41 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 531 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  24.85 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  22.95 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  23.97 
 
 		 511 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>