More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6289 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 510 aa  1044    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 484 aa  306  6e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  30.48 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  30.72 
 
 		 523 aa  240  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 500 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  29.5 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 563 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  26.16 
 
 		 496 aa  223  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  29.77 
 
 		 501 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  26.08 
 
 		 503 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  25.93 
 
 		 518 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.13 
 
 		 740 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  27.58 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 502 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  27.86 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  25.47 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  26.94 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.64 
 
 		 506 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  25.16 
 
 		 938 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  25.56 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  25.35 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  27.27 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  26.95 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.75 
 
 		 507 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  26.9 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  25.73 
 
 		 508 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.64 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.42 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  24.02 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 532 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  24.26 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  26.36 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  26.94 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  26.13 
 
 		 504 aa  104  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  23.26 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 512 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  25.65 
 
 		 505 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  25.56 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  23.62 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.27 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 497 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.28 
 
 		 542 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.05 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.52 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.6 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 497 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.82 
 
 		 516 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  27.8 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.24 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 512 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.81 
 
 		 598 aa  94  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 547 aa  94  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 506 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  22.2 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  23.35 
 
 		 595 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 498 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.55 
 
 		 509 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  28.76 
 
 		 511 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  22.66 
 
 		 553 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  23.97 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  22.97 
 
 		 519 aa  88.2  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  26.04 
 
 		 508 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  25.73 
 
 		 508 aa  87  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  27.54 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  23.91 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  23.81 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  27.82 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  23.21 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  21.53 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  22.44 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.36 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  22.94 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  24.84 
 
 		 708 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  24.02 
 
 		 554 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  20.12 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 		 73 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  22.07 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  21.53 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  25 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  26.36 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.88 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  21.17 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  24.54 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  25.58 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  20.65 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  24.57 
 
 		 711 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  23.9 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  22.55 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.28 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  22.55 
 
 		 497 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  24.7 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>