More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2640 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  100 
 
 		 497 aa  1033    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  100 
 
 		 497 aa  1033    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  35.23 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  33.06 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  32.86 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  32.67 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  33.83 
 
 		 509 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  32.22 
 
 		 518 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  34.98 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  35.09 
 
 		 491 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  33.76 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  31.74 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  30.4 
 
 		 490 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  29.16 
 
 		 492 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.63 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  29.55 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  28.92 
 
 		 537 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  28.63 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  28.72 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  30.39 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  27.55 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.9 
 
 		 507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  28.27 
 
 		 519 aa  220  6e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.77 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  31.3 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.15 
 
 		 508 aa  216  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 516 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  28.48 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  28.07 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.37 
 
 		 507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  28.37 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  27.87 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  26.5 
 
 		 504 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  27.33 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.46 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  28.06 
 
 		 497 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  28.23 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  27.65 
 
 		 527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 524 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  26.41 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.57 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.44 
 
 		 498 aa  196  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  30.39 
 
 		 495 aa  196  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  25.26 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  28.31 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  27.89 
 
 		 494 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  28.42 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  30.51 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 508 aa  193  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  26.39 
 
 		 542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  29.96 
 
 		 523 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  27.86 
 
 		 536 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  28.66 
 
 		 475 aa  190  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  27.86 
 
 		 488 aa  189  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  25.47 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  27.78 
 
 		 519 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.55 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  28.87 
 
 		 496 aa  187  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  27.31 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  26.19 
 
 		 491 aa  186  9e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  27.61 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  27.42 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  25.52 
 
 		 525 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  27.68 
 
 		 532 aa  183  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  26.65 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  25.2 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.91 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  27.13 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  27.9 
 
 		 508 aa  182  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  27.74 
 
 		 499 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 495 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  26.15 
 
 		 519 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  28.05 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.51 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  27.63 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  26.07 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  26.65 
 
 		 499 aa  177  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  25.15 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  25.15 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  28.26 
 
 		 550 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  26.3 
 
 		 566 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  25.73 
 
 		 524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  26.43 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  28.23 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  26.2 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  24.42 
 
 		 496 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  27.73 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  25.62 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 531 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  26.11 
 
 		 495 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  23.48 
 
 		 503 aa  170  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  26.54 
 
 		 532 aa  169  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  24.33 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  24.44 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  26.68 
 
 		 530 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  25.81 
 
 		 526 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>