More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2983 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  100 
 
 		 495 aa  1007    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  62.17 
 
 		 491 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  60.9 
 
 		 502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  55.07 
 
 		 495 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  37.7 
 
 		 505 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  34.11 
 
 		 497 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  34.11 
 
 		 497 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  40.41 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  36.29 
 
 		 509 aa  293  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  35.52 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  35.52 
 
 		 512 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  34.7 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  34.84 
 
 		 509 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  39.12 
 
 		 471 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  32.72 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  39.42 
 
 		 475 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  34.97 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  33.4 
 
 		 504 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  32.51 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  34.49 
 
 		 525 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  33 
 
 		 493 aa  256  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  29.88 
 
 		 537 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  32.92 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  32.51 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  31.01 
 
 		 490 aa  249  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  32.92 
 
 		 511 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  38.11 
 
 		 500 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  35.09 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  33.06 
 
 		 497 aa  246  8e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  37.97 
 
 		 496 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  32.59 
 
 		 498 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  33.06 
 
 		 500 aa  243  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 524 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  33.95 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 507 aa  237  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  32.51 
 
 		 508 aa  237  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  33 
 
 		 530 aa  236  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  32.84 
 
 		 530 aa  236  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  33 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 495 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  32.17 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  32.35 
 
 		 496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  30.3 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  32.31 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  37.15 
 
 		 495 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  33.54 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  35.89 
 
 		 520 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  31.82 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  27.31 
 
 		 502 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  27.31 
 
 		 502 aa  227  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  32.19 
 
 		 504 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  32.06 
 
 		 531 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  27.44 
 
 		 494 aa  224  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  30.88 
 
 		 491 aa  223  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  31.48 
 
 		 508 aa  223  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  28.54 
 
 		 497 aa  223  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  32.34 
 
 		 508 aa  223  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  35.54 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  30.38 
 
 		 499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  30.41 
 
 		 519 aa  220  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  33.55 
 
 		 492 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  31.14 
 
 		 529 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  31.97 
 
 		 506 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  32.92 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  32.13 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  31.65 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  33.12 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  33.91 
 
 		 499 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  32.72 
 
 		 506 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  33.19 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  30.86 
 
 		 527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  32.05 
 
 		 509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  26.48 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  29.54 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  28.46 
 
 		 488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  32.86 
 
 		 519 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  35.38 
 
 		 523 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  33.91 
 
 		 499 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  27.96 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  34.05 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  32.11 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  33.26 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  30.72 
 
 		 518 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  35.4 
 
 		 495 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  32.79 
 
 		 494 aa  209  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  29.27 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  32.34 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  34.07 
 
 		 499 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  29.74 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  35.37 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  29.2 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  29.62 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  28.34 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  31.49 
 
 		 548 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  33.13 
 
 		 502 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.72 
 
 		 509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  28.25 
 
 		 501 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>