238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5124 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5124  zeta-phytoene desaturase  100 
 
 		 452 aa  859    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229738  normal  0.0794369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1392  FAD dependent oxidoreductase  66.89 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000446309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1108  phytoene desaturase  61.3 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3225  Zeta-phytoene desaturase  55.29 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  hitchhiker  0.00724213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2546  phytoene desaturase  53.04 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3475  zeta-phytoene desaturase  50.54 
 
 		 495 aa  339  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419175  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  50.33 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3833  hydroxyneurosporene dehydrogenase  44.52 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  36 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  36.14 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  33.91 
 
 		 509 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  34.12 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  33.91 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6441  hydroxyneurosporene and rhodopin dehydrogenase  34.22 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  31.17 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 516 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  34.51 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 524 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  33.55 
 
 		 512 aa  189  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  34.92 
 
 		 495 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  32.83 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2953  phytoene desaturase  36.89 
 
 		 499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2984  CrtD protein  34.5 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2726  phytoene desaturase  36.89 
 
 		 499 aa  183  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  34.21 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1614  phytoene dehydrogenase-related protein  34.79 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2048  phytoene desaturase  33.55 
 
 		 515 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  28.1 
 
 		 497 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  28.1 
 
 		 497 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2848  phytoene desaturase  37.78 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.984953  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2822  phytoene desaturase  35.67 
 
 		 511 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.429882  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 519 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  33.04 
 
 		 523 aa  170  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  31.07 
 
 		 490 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  31.33 
 
 		 530 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  30.07 
 
 		 524 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  29.52 
 
 		 507 aa  159  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  27.9 
 
 		 497 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  29.69 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  30.69 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  27.69 
 
 		 553 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  30.26 
 
 		 530 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  31.72 
 
 		 508 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  32.61 
 
 		 525 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.43 
 
 		 511 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2040  phytoene dehydrogenase-related protein  33.48 
 
 		 495 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.492251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3513  methoxyneurosporene dehydrogenase  34.52 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.705776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  29.4 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  28.23 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.96 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  30.35 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3693  phytoene desaturase  35.43 
 
 		 499 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  28.07 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  23.92 
 
 		 502 aa  143  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  23.92 
 
 		 502 aa  143  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  29.12 
 
 		 518 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.8 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  27.03 
 
 		 499 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  27.31 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  27.13 
 
 		 475 aa  140  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  26.45 
 
 		 519 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  25.71 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  28.95 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  28.26 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.63 
 
 		 495 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  34 
 
 		 566 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  28.85 
 
 		 508 aa  136  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  28.85 
 
 		 508 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0266  methoxyneurosporene dehydrogenase  33.41 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  30.9 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.67 
 
 		 511 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.98 
 
 		 511 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  30.66 
 
 		 532 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  32.4 
 
 		 552 aa  133  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.09 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  31.62 
 
 		 548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  29.27 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  29.27 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  27.51 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  28.29 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  31.99 
 
 		 536 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  29.74 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  28.11 
 
 		 496 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  30.9 
 
 		 553 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  29.34 
 
 		 546 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  33.4 
 
 		 550 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  28.7 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  30.8 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  29.87 
 
 		 556 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  30.2 
 
 		 492 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  26.23 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  27.21 
 
 		 504 aa  123  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  28.2 
 
 		 504 aa  123  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  30.62 
 
 		 552 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  25.31 
 
 		 519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  28.07 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  33.26 
 
 		 551 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  27.93 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  20.87 
 
 		 494 aa  120  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>